More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0768 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0768  DNA polymerase III subunit epsilon  100 
 
 		 262 aa  534  1e-151  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0863  DNA polymerase III subunit epsilon  58.75 
 
 		 265 aa  309  2.9999999999999997e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1341  DNA polymerase III subunit epsilon  53.73 
 
 		 267 aa  278  8e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.426567  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0726  DNA polymerase III subunit epsilon  51.76 
 
 		 273 aa  275  4e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1027  DNA polymerase III subunit epsilon  47.37 
 
 		 254 aa  228  8e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.512461  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0477  DNA polymerase III subunit epsilon  46.43 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.387234  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0502  DNA polymerase III subunit epsilon  51.43 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1605  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.72 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1607  DNA polymerase III subunit epsilon  46.08 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  41.15 
 
 		 1449 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  36.76 
 
 		 1397 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  35.75 
 
 		 1438 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  35.75 
 
 		 1438 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  40.62 
 
 		 1449 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  35.75 
 
 		 1436 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  35.76 
 
 		 720 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  40.45 
 
 		 1442 aa  109  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  34.95 
 
 		 584 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  34.95 
 
 		 570 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  39.56 
 
 		 1433 aa  106  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  37.43 
 
 		 601 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  35.4 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  34.92 
 
 		 645 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  36.04 
 
 		 551 aa  102  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  35 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  34.78 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  34.78 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  34.78 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  34.78 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  34.78 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  38.3 
 
 		 929 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  34.78 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  34.16 
 
 		 299 aa  99.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  35.29 
 
 		 603 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  34.16 
 
 		 315 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  36.56 
 
 		 1435 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  35.94 
 
 		 1402 aa  99  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.9 
 
 		 631 aa  99  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  35.23 
 
 		 1465 aa  97.8  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  34.76 
 
 		 578 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2024  Rad3-related DNA helicase  38.59 
 
 		 791 aa  98.2  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.63 
 
 		 595 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  33.88 
 
 		 616 aa  97.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  35.57 
 
 		 601 aa  97.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.51 
 
 		 609 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.51 
 
 		 595 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  34.38 
 
 		 315 aa  97.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.78 
 
 		 584 aa  97.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  35.23 
 
 		 630 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  31.48 
 
 		 1440 aa  96.3  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.97 
 
 		 610 aa  95.9  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.69 
 
 		 565 aa  95.5  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  33.16 
 
 		 1421 aa  95.5  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  34.46 
 
 		 617 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  36.7 
 
 		 934 aa  95.5  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  36.32 
 
 		 1407 aa  95.5  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1099  Rad3-related DNA helicase  35.29 
 
 		 489 aa  95.5  9e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.829267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.64 
 
 		 934 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.64 
 
 		 934 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.64 
 
 		 934 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.64 
 
 		 934 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.64 
 
 		 934 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.64 
 
 		 934 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  36.7 
 
 		 934 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  34.22 
 
 		 578 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  36.7 
 
 		 934 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  34.66 
 
 		 630 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  34.55 
 
 		 585 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  34.66 
 
 		 630 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.69 
 
 		 605 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.64 
 
 		 934 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  34.91 
 
 		 954 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  33.33 
 
 		 590 aa  92.8  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  33.33 
 
 		 1433 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.24 
 
 		 205 aa  92.4  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  32.81 
 
 		 970 aa  92  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  32.81 
 
 		 1433 aa  92  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  32.82 
 
 		 574 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  32.81 
 
 		 1433 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  32.81 
 
 		 1433 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  33.33 
 
 		 1433 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  32.81 
 
 		 1433 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  33.33 
 
 		 1433 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  33.33 
 
 		 1433 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  33.33 
 
 		 1433 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  30.58 
 
 		 613 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  33.85 
 
 		 1444 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  32.29 
 
 		 1433 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.29 
 
 		 715 aa  90.1  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  36.81 
 
 		 1362 aa  89.4  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  35.93 
 
 		 1367 aa  89  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  35.93 
 
 		 1367 aa  89  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  30.61 
 
 		 566 aa  89  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.7 
 
 		 769 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  33.51 
 
 		 584 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  31.34 
 
 		 574 aa  86.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2247  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.34 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000477719  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  28.75 
 
 		 1390 aa  84.3  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1025  DNA polymerase III, epsilon subunit/ATP-dependent helicase DinG  33.33 
 
 		 902 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.88 
 
 		 944 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>