More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0502 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0502  DNA polymerase III subunit epsilon  100 
 
 		 233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0477  DNA polymerase III subunit epsilon  96.96 
 
 		 253 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.387234  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1027  DNA polymerase III subunit epsilon  68.26 
 
 		 254 aa  327  9e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.512461  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1341  DNA polymerase III subunit epsilon  54.67 
 
 		 267 aa  249  2e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.426567  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0863  DNA polymerase III subunit epsilon  55.24 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0726  DNA polymerase III subunit epsilon  52.19 
 
 		 273 aa  243  9.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0768  DNA polymerase III subunit epsilon  51.43 
 
 		 262 aa  224  8e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1605  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.78 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1607  DNA polymerase III subunit epsilon  40.09 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  42.94 
 
 		 1397 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  36.51 
 
 		 584 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  34.38 
 
 		 570 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.63 
 
 		 610 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  37.7 
 
 		 1433 aa  113  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  36.9 
 
 		 630 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  41.92 
 
 		 1449 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  38.46 
 
 		 1442 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  36.31 
 
 		 630 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  36.31 
 
 		 630 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  41.32 
 
 		 1449 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  36.84 
 
 		 645 aa  109  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.28 
 
 		 595 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  43.12 
 
 		 1402 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  34.85 
 
 		 601 aa  108  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  36.7 
 
 		 616 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.51 
 
 		 769 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  40.93 
 
 		 1407 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  35.29 
 
 		 578 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  35.93 
 
 		 617 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  36.48 
 
 		 315 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  35.82 
 
 		 1465 aa  105  7e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.96 
 
 		 605 aa  105  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.91 
 
 		 565 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  40.13 
 
 		 1367 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  36.76 
 
 		 1436 aa  103  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  41.72 
 
 		 1426 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  40.13 
 
 		 1367 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.72 
 
 		 631 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  36.76 
 
 		 1438 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  36.76 
 
 		 1438 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  34.78 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  35.22 
 
 		 315 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  35.22 
 
 		 315 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  35.22 
 
 		 315 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  35.22 
 
 		 315 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  35.22 
 
 		 315 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  33.33 
 
 		 578 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  35.05 
 
 		 601 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.61 
 
 		 715 aa  102  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  35.22 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  35.22 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.26 
 
 		 584 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 		 595 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  34.78 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.45 
 
 		 609 aa  99.8  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  35.22 
 
 		 299 aa  99.4  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5255  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.27 
 
 		 180 aa  99  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000603191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.88 
 
 		 456 aa  98.2  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  35.58 
 
 		 1390 aa  97.1  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  34.41 
 
 		 585 aa  97.1  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  34.55 
 
 		 603 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  38.18 
 
 		 720 aa  96.3  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  33.33 
 
 		 566 aa  96.7  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  37.65 
 
 		 934 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  37.65 
 
 		 934 aa  95.9  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  37.65 
 
 		 934 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  37.65 
 
 		 934 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  33.85 
 
 		 551 aa  95.9  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  37.65 
 
 		 934 aa  95.5  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  37.65 
 
 		 934 aa  95.5  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  34.85 
 
 		 574 aa  95.5  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  37.65 
 
 		 934 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  38.24 
 
 		 934 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  38.24 
 
 		 934 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  38.36 
 
 		 929 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  34.18 
 
 		 574 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  33.15 
 
 		 590 aa  93.6  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.65 
 
 		 196 aa  94  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  37.65 
 
 		 934 aa  93.2  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  33.33 
 
 		 584 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.71 
 
 		 449 aa  93.2  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.8 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  36.9 
 
 		 1421 aa  93.2  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1025  DNA polymerase III, epsilon subunit/ATP-dependent helicase DinG  32.78 
 
 		 902 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.47 
 
 		 944 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  33.73 
 
 		 1433 aa  90.1  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  35.96 
 
 		 613 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1099  Rad3-related DNA helicase  35.26 
 
 		 489 aa  90.9  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.829267  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1467  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.41 
 
 		 475 aa  90.9  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.230111  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0149  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.98 
 
 		 187 aa  89.7  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  32.99 
 
 		 1435 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.88 
 
 		 921 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1068  DNA polymerase III, epsilon chain  34.36 
 
 		 277 aa  89.4  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2024  Rad3-related DNA helicase  32.97 
 
 		 791 aa  89.4  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  31.34 
 
 		 954 aa  89.4  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2247  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.15 
 
 		 252 aa  88.6  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000477719  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.75 
 
 		 459 aa  88.6  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4120  DNA-directed DNA polymerase  31.89 
 
 		 203 aa  88.6  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242284  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  34.67 
 
 		 1362 aa  88.2  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  34.41 
 
 		 1444 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>