More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0417 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 196 aa  395  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.34 
 
 		 205 aa  155  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  39.88 
 
 		 1397 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.29 
 
 		 565 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  41.25 
 
 		 1433 aa  129  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  38.42 
 
 		 1367 aa  121  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  38.42 
 
 		 1367 aa  121  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  40.22 
 
 		 1402 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  34.34 
 
 		 570 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.88 
 
 		 921 aa  118  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  40.85 
 
 		 1449 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  39.43 
 
 		 1407 aa  115  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1576  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.16 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  35.93 
 
 		 1442 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  40.24 
 
 		 1449 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1871  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.97 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235733  hitchhiker  0.000714256 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.04 
 
 		 449 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  38.1 
 
 		 1465 aa  112  5e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  33.73 
 
 		 584 aa  111  6e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  35.98 
 
 		 574 aa  111  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  38.69 
 
 		 1390 aa  111  7.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1445  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.07 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000779612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.36 
 
 		 456 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.09 
 
 		 944 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  36.05 
 
 		 1437 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0009  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.32 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1383  exonuclease  37.58 
 
 		 181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  36.53 
 
 		 574 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  36.94 
 
 		 560 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.8 
 
 		 956 aa  108  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  32 
 
 		 1443 aa  108  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  35.26 
 
 		 1426 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  36.11 
 
 		 1365 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  35.83 
 
 		 1440 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1999  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.2 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  36.31 
 
 		 1421 aa  105  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0987  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.75 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.750211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.73 
 
 		 595 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  35.5 
 
 		 1527 aa  105  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3777  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.47 
 
 		 722 aa  105  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0222  exonuclease  34.91 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4120  DNA-directed DNA polymerase  32.57 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242284  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.88 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  34.08 
 
 		 1447 aa  104  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  31.58 
 
 		 578 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  34.76 
 
 		 1435 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.18 
 
 		 934 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.1 
 
 		 927 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5151  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.97 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5255  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.57 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000603191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  31.93 
 
 		 578 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  40.67 
 
 		 720 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0024  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.77 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13734 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  33.14 
 
 		 1433 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  33.14 
 
 		 1433 aa  101  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2625  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.62 
 
 		 300 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.401759  hitchhiker  0.000000993281 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  34.97 
 
 		 1444 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.1 
 
 		 584 aa  100  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  33.53 
 
 		 585 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2656  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.01 
 
 		 456 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0076  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.04 
 
 		 442 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  32.37 
 
 		 1433 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  32.37 
 
 		 1433 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  32.37 
 
 		 1433 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  32.37 
 
 		 1433 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.84 
 
 		 463 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  35.26 
 
 		 1388 aa  99.4  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  32.56 
 
 		 1433 aa  99.4  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  32.56 
 
 		 1433 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  32.56 
 
 		 1433 aa  99.4  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  32 
 
 		 1433 aa  99  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2572  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.14 
 
 		 476 aa  99  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  34.3 
 
 		 617 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  33.13 
 
 		 1464 aa  98.6  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2003  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.14 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187406  hitchhiker  0.0000370659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3055  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.22 
 
 		 218 aa  98.2  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000215012  normal  0.403566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  32.54 
 
 		 584 aa  98.6  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2355  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.14 
 
 		 208 aa  98.2  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  33.33 
 
 		 630 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  33.33 
 
 		 630 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2460  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.14 
 
 		 208 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2344  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.14 
 
 		 208 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.93 
 
 		 934 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.93 
 
 		 934 aa  97.8  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.93 
 
 		 934 aa  97.8  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  31.98 
 
 		 970 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.13 
 
 		 952 aa  97.1  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1381  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.21 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.348365  normal  0.0969598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5296  DNA-directed DNA polymerase  31.36 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0646344 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.97 
 
 		 453 aa  97.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  33.33 
 
 		 630 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.33 
 
 		 934 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.33 
 
 		 934 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.33 
 
 		 934 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.33 
 
 		 934 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.31 
 
 		 731 aa  97.1  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2247  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.47 
 
 		 252 aa  96.7  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000477719  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  38 
 
 		 930 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2114  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.35 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  33.99 
 
 		 1468 aa  95.9  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>