More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1902 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 707 aa  1420    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0668  putative PAS/PAC sensor protein  53.54 
 
 		 719 aa  687    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2006  putative PAS/PAC sensor protein  63.16 
 
 		 729 aa  832    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475164 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2053  putative PAS/PAC sensor protein  44.24 
 
 		 714 aa  496  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115114 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.48 
 
 		 769 aa  385  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4151  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.17 
 
 		 729 aa  369  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.82 
 
 		 731 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.32 
 
 		 721 aa  362  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.13 
 
 		 706 aa  361  3e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3777  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.27 
 
 		 722 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.91 
 
 		 719 aa  342  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  34.48 
 
 		 695 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.32 
 
 		 695 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.01 
 
 		 695 aa  296  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3559  DNA polymerase III subunit epsilon  46.3 
 
 		 485 aa  203  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1505  putative sensor with HAMP domain  48.89 
 
 		 616 aa  201  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4556  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.99 
 
 		 659 aa  194  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3669  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.29 
 
 		 479 aa  189  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.731231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  43.96 
 
 		 1442 aa  146  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  42.41 
 
 		 1407 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  39.89 
 
 		 1433 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  39.15 
 
 		 1433 aa  134  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  38.1 
 
 		 970 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  38.62 
 
 		 1433 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  38.62 
 
 		 1433 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  38.1 
 
 		 1433 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  38.1 
 
 		 1433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  38.1 
 
 		 1433 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  38.1 
 
 		 1433 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  38.1 
 
 		 1433 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  38.1 
 
 		 1433 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  38.1 
 
 		 1433 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2003  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.46 
 
 		 247 aa  129  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  37 
 
 		 498 aa  128  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.44 
 
 		 180 aa  127  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  37.43 
 
 		 1435 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  38.42 
 
 		 1465 aa  126  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  39.01 
 
 		 1436 aa  125  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  36.82 
 
 		 1421 aa  125  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  39.02 
 
 		 551 aa  125  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  36.7 
 
 		 1444 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  39.34 
 
 		 584 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1848  DNA-directed DNA polymerase  38.38 
 
 		 233 aa  122  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  38.89 
 
 		 1438 aa  121  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  38.89 
 
 		 1438 aa  121  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  37.67 
 
 		 566 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  38.33 
 
 		 1449 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  37.43 
 
 		 315 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  37.43 
 
 		 315 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  37.78 
 
 		 1449 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  37.02 
 
 		 315 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  37.43 
 
 		 315 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3448  DNA polymerase III subunit epsilon  38.67 
 
 		 230 aa  117  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  37.43 
 
 		 315 aa  118  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1236  putative DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease  40.36 
 
 		 229 aa  117  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2897  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.36 
 
 		 229 aa  117  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0541355  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  37.43 
 
 		 315 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  37.38 
 
 		 590 aa  117  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  35.23 
 
 		 1367 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  37.57 
 
 		 315 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  37.5 
 
 		 239 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  36.27 
 
 		 1397 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  35.23 
 
 		 1367 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2673  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.12 
 
 		 237 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  36.55 
 
 		 1440 aa  116  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.38 
 
 		 565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  36.84 
 
 		 315 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  35.23 
 
 		 1390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.16 
 
 		 236 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  36.84 
 
 		 315 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0424  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.79 
 
 		 186 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0439  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.79 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  37.57 
 
 		 315 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  36.72 
 
 		 1447 aa  112  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  37.78 
 
 		 1365 aa  112  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  36.59 
 
 		 584 aa  111  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1486  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.65 
 
 		 236 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0964346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1004  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.7 
 
 		 282 aa  110  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.26 
 
 		 921 aa  110  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.92 
 
 		 584 aa  110  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.31 
 
 		 595 aa  110  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  37.42 
 
 		 299 aa  110  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  37.07 
 
 		 603 aa  110  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  37.7 
 
 		 1426 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  35.23 
 
 		 1527 aa  109  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1485  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.65 
 
 		 241 aa  109  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00650497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  38.27 
 
 		 574 aa  109  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  35.29 
 
 		 616 aa  109  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1567  DNA-directed DNA polymerase  39.04 
 
 		 236 aa  108  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1871  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.86 
 
 		 204 aa  108  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235733  hitchhiker  0.000714256 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  37.06 
 
 		 1432 aa  107  6e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1763  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.06 
 
 		 236 aa  107  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.312232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  37.89 
 
 		 578 aa  106  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.22 
 
 		 595 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  37.82 
 
 		 601 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2828  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.67 
 
 		 234 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.37287  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  36.16 
 
 		 1402 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  38.66 
 
 		 574 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.27 
 
 		 631 aa  105  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  36.23 
 
 		 645 aa  105  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>