More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0978 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0978  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 
280 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0235504  normal  0.0652516 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1004  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.93 
 
 
282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  36.99 
 
 
921 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  36.42 
 
 
217 aa  99.8  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0803  DNA polymerase III subunit epsilon  37.82 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1284  DNA polymerase III subunit epsilon  37.82 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000499827  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1255  DNA polymerase III subunit epsilon  37.82 
 
 
244 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0108719  normal  0.264434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.6 
 
 
453 aa  96.3  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  35 
 
 
603 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  35.71 
 
 
566 aa  94.7  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1662  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.74 
 
 
232 aa  95.1  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.862026 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2874  DNA polymerase III subunit epsilon  39.74 
 
 
244 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0167654  normal  0.331291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  32.68 
 
 
574 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1592  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  37.19 
 
 
238 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4426  DNA polymerase III subunit epsilon  37.82 
 
 
244 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000436585  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  35.47 
 
 
584 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  36.42 
 
 
909 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  32.65 
 
 
578 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1250  DNA polymerase III subunit epsilon  38.46 
 
 
244 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687426  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  33.54 
 
 
457 aa  92.8  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1478  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.84 
 
 
231 aa  92.8  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  normal  0.333081 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1161  DNA polymerase III subunit epsilon  37.18 
 
 
244 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0076  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.25 
 
 
442 aa  92.4  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2036  DNA polymerase III subunit epsilon  36.54 
 
 
244 aa  92  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1173  DNA polymerase III subunit epsilon  37.18 
 
 
244 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0867  DNA polymerase III subunit epsilon  37.82 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20144  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1384  Rad3-related DNA helicase  34.13 
 
 
797 aa  91.7  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  35.44 
 
 
574 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  34.68 
 
 
934 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.29 
 
 
610 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  34.68 
 
 
934 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.31 
 
 
609 aa  90.1  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.26 
 
 
934 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.26 
 
 
934 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2148  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.58 
 
 
235 aa  89.7  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.26 
 
 
934 aa  89.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.26 
 
 
934 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1751  DNA polymerase III subunit epsilon  37.58 
 
 
242 aa  89.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.26 
 
 
934 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.69 
 
 
595 aa  89.4  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.26 
 
 
934 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  35.26 
 
 
934 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  32.31 
 
 
570 aa  89.4  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1607  DNA polymerase III subunit epsilon  30.16 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  34.1 
 
 
929 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  34.68 
 
 
934 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1339  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.32 
 
 
201 aa  87.8  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0133405  hitchhiker  0.000000000461521 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  32.54 
 
 
954 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0564  DNA polymerase III, epsilon subunit  40 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.95 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0400  DNA polymerase III, epsilon subunit  40 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  35.06 
 
 
1440 aa  87.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  32.57 
 
 
1436 aa  87  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1872  DNA polymerase III subunit epsilon  36.54 
 
 
242 aa  87  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000816139  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.67 
 
 
225 aa  87.4  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  34.16 
 
 
585 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  32.57 
 
 
1438 aa  86.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  32.57 
 
 
1438 aa  86.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2073  DNA polymerase III subunit epsilon  36.94 
 
 
242 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2190  DNA polymerase III subunit epsilon  36.54 
 
 
240 aa  86.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1236  putative DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease  34.34 
 
 
229 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  31.09 
 
 
584 aa  86.3  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0470  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.02 
 
 
228 aa  86.3  5e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  30.93 
 
 
1367 aa  86.3  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  30.93 
 
 
1367 aa  86.3  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  35.06 
 
 
578 aa  86.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1272  DNA polymerase III subunit epsilon  34.91 
 
 
253 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.78 
 
 
236 aa  86.3  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1599  DNA polymerase III subunit epsilon  34.91 
 
 
253 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1465  DNA polymerase III subunit epsilon  34.91 
 
 
253 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0597  DNA polymerase III subunit epsilon  34.91 
 
 
253 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1495  DNA polymerase III subunit epsilon  34.91 
 
 
253 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.91 
 
 
459 aa  85.5  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  40 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2897  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.84 
 
 
229 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0541355  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2379  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.58 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  36.96 
 
 
560 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0532  DNA polymerase III subunit epsilon  31.16 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.836516  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  34.69 
 
 
617 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0762  DNA polymerase III subunit epsilon  35.9 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869408  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0555  DNA polymerase III subunit epsilon  35.9 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.38 
 
 
921 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2791  DNA polymerase III subunit epsilon  35.26 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0063034  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1644  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.98 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264964  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2138  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.98 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985286 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3213  DNA polymerase III subunit epsilon  39.46 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.44 
 
 
449 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0262  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.16 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5255  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
180 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000603191  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.83 
 
 
706 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2209  DNA polymerase III subunit epsilon  35.9 
 
 
241 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000456486  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.82 
 
 
595 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1705  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.4 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193811  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.2 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  30.69 
 
 
601 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1467  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.68 
 
 
475 aa  83.2  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.230111  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  34.41 
 
 
590 aa  82.8  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  31.98 
 
 
630 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2449  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.81 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365574  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2814  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.9 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>