More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2765 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  63.39 
 
 		 226 aa  286  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0113  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.07 
 
 		 230 aa  242  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3611  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.39 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1251  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.85 
 
 		 228 aa  229  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2838  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.88 
 
 		 231 aa  222  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0462127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0158  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.45 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0303  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.88 
 
 		 232 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.55 
 
 		 236 aa  214  8e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0398  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.21 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0423  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.33 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0297  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.77 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3448  DNA polymerase III subunit epsilon  47.35 
 
 		 230 aa  208  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  45.09 
 
 		 239 aa  208  7e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5011  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.27 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0105  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.66 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.22 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1831  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.97 
 
 		 240 aa  202  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  50.44 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0849  DNA polymerase III subunit epsilon  48.03 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577786  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2071  DNA polymerase III subunit epsilon  48.92 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1991  DNA polymerase III subunit epsilon  48.92 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2828  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.46 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.37287  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0194  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.46 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2673  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.27 
 
 		 237 aa  198  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0115  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.22 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196999  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1763  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.75 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.312232 
 
 
-
 
NC_002978  WD0108  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.7 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.223432  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1485  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.75 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00650497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2815  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.68 
 
 		 239 aa  194  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2858  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.21 
 
 		 243 aa  193  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.629828  normal  0.501512 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3213  DNA polymerase III subunit epsilon  48.25 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.7 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1236  putative DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease  50.25 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2897  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.25 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0541355  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1486  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.02 
 
 		 236 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0964346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4282  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.22 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0555283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1278  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.32 
 
 		 238 aa  188  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2978  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.75 
 
 		 230 aa  188  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.98 
 
 		 243 aa  187  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3939  DNA polymerase III subunit epsilon  44.92 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.945097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1033  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.09 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.5 
 
 		 238 aa  184  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.1 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0470  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.18 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0006  DNA polymerase III subunit epsilon  46.72 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4265  DNA polymerase III subunit epsilon  44.26 
 
 		 240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0473  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.59 
 
 		 240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.191106  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0930  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.05 
 
 		 231 aa  179  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2364  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.45 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002773  DNA polymerase III epsilon subunit  43.97 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1284  DNA polymerase III subunit epsilon  45.49 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000499827  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0803  DNA polymerase III subunit epsilon  45.49 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0762  DNA polymerase III subunit epsilon  46.44 
 
 		 240 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869408  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0555  DNA polymerase III subunit epsilon  46.44 
 
 		 240 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1339  hypothetical protein  42.01 
 
 		 233 aa  177  8e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1335  hypothetical protein  42.01 
 
 		 233 aa  177  8e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1255  DNA polymerase III subunit epsilon  45.26 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0108719  normal  0.264434 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0597  DNA polymerase III subunit epsilon  46.44 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1599  DNA polymerase III subunit epsilon  46.44 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1495  DNA polymerase III subunit epsilon  46.44 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1478  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.92 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  normal  0.333081 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1465  DNA polymerase III subunit epsilon  46.44 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1272  DNA polymerase III subunit epsilon  46.44 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2036  DNA polymerase III subunit epsilon  45.92 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1250  DNA polymerase III subunit epsilon  44.77 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2874  DNA polymerase III subunit epsilon  45.34 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0167654  normal  0.331291 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1825  DNA polymerase III subunit epsilon  42.74 
 
 		 247 aa  175  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0501  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.35 
 
 		 238 aa  175  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4426  DNA polymerase III subunit epsilon  45.49 
 
 		 244 aa  175  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000436585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2138  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.37 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985286 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1644  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.37 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264964  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2791  DNA polymerase III subunit epsilon  46.15 
 
 		 241 aa  174  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0063034  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0426  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.36 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.32865  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.7 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1761  DNA polymerase III, epsilon chain  42.98 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2288  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.08 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521561  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0956  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.49 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1041  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.13 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1161  DNA polymerase III subunit epsilon  44.64 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1027  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.98 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.134047  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1592  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  52.33 
 
 		 238 aa  172  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1173  DNA polymerase III subunit epsilon  44.64 
 
 		 244 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1827  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.18 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3713  DNA polymerase III subunit epsilon  46.64 
 
 		 252 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.687255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03210  DNA polymerase III subunit epsilon  41.56 
 
 		 238 aa  170  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2449  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.1 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1705  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.51 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193811  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0867  DNA polymerase III subunit epsilon  44.59 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20144  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0839  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.67 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2814  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.99 
 
 		 243 aa  168  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0912  DNA polymerase III subunit epsilon  40.66 
 
 		 246 aa  167  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4141  DNA polymerase III subunit epsilon  44.49 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.962875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1724  DNA polymerase III subunit epsilon  44.49 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3466  DNA polymerase III subunit epsilon  43.81 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.37 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1941  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.76 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2209  DNA polymerase III subunit epsilon  44.02 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000456486  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0845  DNA polymerase III subunit epsilon  41.52 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  45.88 
 
 		 527 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.13569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>