More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1384 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1384  Rad3-related DNA helicase  100 
 
 
797 aa  1622    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  37.56 
 
 
954 aa  256  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1030  Rad3-related DNA helicase  35.17 
 
 
937 aa  211  3e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0174435  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.63 
 
 
909 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1099  Rad3-related DNA helicase  32.59 
 
 
489 aa  202  1.9999999999999998e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.829267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.56 
 
 
921 aa  196  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.13 
 
 
934 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.67 
 
 
934 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.67 
 
 
934 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.45 
 
 
934 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.59 
 
 
934 aa  185  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.22 
 
 
934 aa  185  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.45 
 
 
934 aa  185  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.45 
 
 
934 aa  185  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.45 
 
 
934 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.59 
 
 
934 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2024  Rad3-related DNA helicase  30.44 
 
 
791 aa  182  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.71 
 
 
929 aa  177  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1514  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  29.7 
 
 
897 aa  152  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.103927  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1543  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  29.7 
 
 
897 aa  152  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.959984  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0524  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.74 
 
 
835 aa  145  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00517102  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1025  DNA polymerase III, epsilon subunit/ATP-dependent helicase DinG  28.93 
 
 
902 aa  144  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.52 
 
 
930 aa  142  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.83 
 
 
921 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  33.65 
 
 
1397 aa  117  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.36 
 
 
459 aa  117  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.61 
 
 
456 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  40 
 
 
1449 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  39.77 
 
 
1407 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.72 
 
 
921 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  33.99 
 
 
1433 aa  112  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  39.43 
 
 
1449 aa  112  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2656  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.42 
 
 
456 aa  111  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  35.09 
 
 
970 aa  109  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  32.57 
 
 
1443 aa  109  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.97 
 
 
944 aa  110  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  36.09 
 
 
1635 aa  109  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  37.36 
 
 
1527 aa  109  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  35.09 
 
 
1433 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  35.09 
 
 
1433 aa  108  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  35.09 
 
 
1433 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  35.09 
 
 
1433 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  36.47 
 
 
1433 aa  108  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.77 
 
 
934 aa  108  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  34.68 
 
 
1468 aa  108  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  35.09 
 
 
1433 aa  108  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  35.09 
 
 
1433 aa  108  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.75 
 
 
769 aa  108  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  35.09 
 
 
1433 aa  108  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5255  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.93 
 
 
180 aa  107  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000603191  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.02 
 
 
956 aa  107  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  27.17 
 
 
929 aa  107  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.61 
 
 
952 aa  107  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  34.5 
 
 
1433 aa  106  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  34.5 
 
 
1433 aa  106  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.73 
 
 
957 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3112  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.01 
 
 
966 aa  105  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000116759  hitchhiker  0.000000000648685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  34.5 
 
 
1444 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  34.91 
 
 
1402 aa  104  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  33.92 
 
 
1435 aa  105  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.57 
 
 
595 aa  103  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  37.93 
 
 
720 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  30.54 
 
 
1365 aa  102  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  34.97 
 
 
1440 aa  102  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  35 
 
 
449 aa  102  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.71 
 
 
453 aa  101  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  37.13 
 
 
315 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0528  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.2 
 
 
375 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000485007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0966  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.2 
 
 
375 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153068  normal  0.250599 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1006  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.2 
 
 
375 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140116  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4114  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.98 
 
 
378 aa  100  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000182264  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.37 
 
 
398 aa  100  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.57 
 
 
565 aa  100  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.52 
 
 
609 aa  100  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0866  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.91 
 
 
375 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000243712  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  35.62 
 
 
1421 aa  100  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0878  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.91 
 
 
375 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628504  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  35.56 
 
 
613 aa  99.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  35.67 
 
 
578 aa  99.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.72 
 
 
715 aa  100  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  36.53 
 
 
315 aa  99  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  36.53 
 
 
315 aa  99  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  34.43 
 
 
1465 aa  99  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  36.53 
 
 
315 aa  98.6  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0076  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.15 
 
 
442 aa  98.6  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3616  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.83 
 
 
530 aa  98.6  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00210343  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  36.25 
 
 
584 aa  98.6  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  36.88 
 
 
315 aa  98.6  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1999  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.43 
 
 
215 aa  98.2  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  34.25 
 
 
560 aa  98.2  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  33.71 
 
 
1464 aa  98.2  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  36.53 
 
 
315 aa  98.2  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.58 
 
 
453 aa  98.2  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  31.95 
 
 
1436 aa  97.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  36.53 
 
 
315 aa  96.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  35.93 
 
 
315 aa  96.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  35.93 
 
 
315 aa  97.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1004  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.83 
 
 
282 aa  97.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  35.44 
 
 
457 aa  96.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  31.95 
 
 
1438 aa  96.3  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>