More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1633 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 721 aa  1473    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3777  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.24 
 
 		 722 aa  709    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4151  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.24 
 
 		 729 aa  707    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.5 
 
 		 731 aa  696    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  57.92 
 
 		 769 aa  900    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.41 
 
 		 719 aa  558  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.37 
 
 		 706 aa  538  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  36.48 
 
 		 707 aa  360  4e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2053  putative PAS/PAC sensor protein  35.56 
 
 		 714 aa  333  9e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115114 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2006  putative PAS/PAC sensor protein  36.02 
 
 		 729 aa  329  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475164 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0668  putative PAS/PAC sensor protein  32.61 
 
 		 719 aa  297  5e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  32.45 
 
 		 695 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.28 
 
 		 695 aa  258  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.67 
 
 		 695 aa  250  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1505  putative sensor with HAMP domain  45.31 
 
 		 616 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3559  DNA polymerase III subunit epsilon  47.17 
 
 		 485 aa  192  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4556  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.28 
 
 		 659 aa  184  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3669  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.13 
 
 		 479 aa  167  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.731231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  41.24 
 
 		 1442 aa  142  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  40.57 
 
 		 1407 aa  139  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  38.25 
 
 		 1440 aa  127  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  39.04 
 
 		 1390 aa  125  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  37.38 
 
 		 1468 aa  126  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  37.99 
 
 		 1449 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  37.84 
 
 		 1527 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  37.43 
 
 		 1449 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  35.23 
 
 		 1421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0424  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.6 
 
 		 186 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  35.87 
 
 		 1464 aa  121  6e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  34.44 
 
 		 1435 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0439  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.6 
 
 		 186 aa  120  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.44 
 
 		 595 aa  120  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  36.07 
 
 		 1465 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  37.16 
 
 		 1397 aa  117  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2003  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.69 
 
 		 247 aa  117  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  36.36 
 
 		 1447 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  34.21 
 
 		 1367 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  34.03 
 
 		 1365 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  33.71 
 
 		 1433 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  35 
 
 		 1444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  34.21 
 
 		 1367 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  34.08 
 
 		 1433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  34.08 
 
 		 1433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  34.08 
 
 		 1433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  34.08 
 
 		 1433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  34.64 
 
 		 1433 aa  114  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  37.24 
 
 		 617 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  34.08 
 
 		 1433 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  34.08 
 
 		 1433 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  33.52 
 
 		 970 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  33.52 
 
 		 1433 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  33.52 
 
 		 1433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  35 
 
 		 1436 aa  112  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.81 
 
 		 180 aa  112  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  36.13 
 
 		 578 aa  111  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  38.89 
 
 		 1388 aa  110  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  34.9 
 
 		 570 aa  110  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  33.52 
 
 		 1433 aa  109  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  34.07 
 
 		 1438 aa  107  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  34.07 
 
 		 1438 aa  107  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1941  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.42 
 
 		 253 aa  107  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  34.91 
 
 		 239 aa  106  1e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  36.53 
 
 		 1432 aa  106  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  36.9 
 
 		 551 aa  107  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02830  hypothetical protein  37.36 
 
 		 204 aa  107  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1763  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.31 
 
 		 236 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.312232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  38.1 
 
 		 584 aa  106  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  35.64 
 
 		 1426 aa  106  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.79 
 
 		 595 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1485  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.31 
 
 		 241 aa  105  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00650497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  30.99 
 
 		 1443 aa  105  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  37.16 
 
 		 315 aa  105  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  35.83 
 
 		 645 aa  105  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  38.8 
 
 		 560 aa  105  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.04 
 
 		 610 aa  104  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  38.29 
 
 		 1402 aa  104  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.81 
 
 		 921 aa  104  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000241  DNA polymerase III alpha subunit  34.38 
 
 		 204 aa  104  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0987  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.88 
 
 		 208 aa  104  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.750211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  38.71 
 
 		 1362 aa  103  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  35.87 
 
 		 315 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1848  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 233 aa  103  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  34.78 
 
 		 217 aa  102  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.23 
 
 		 565 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  36.61 
 
 		 315 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2613  DNA polymerase III subunit  35.33 
 
 		 222 aa  103  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.88 
 
 		 944 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2897  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.15 
 
 		 229 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0541355  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  36.13 
 
 		 584 aa  102  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  36.99 
 
 		 315 aa  101  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1236  putative DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease  35.15 
 
 		 229 aa  101  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  36.42 
 
 		 315 aa  101  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  36.42 
 
 		 315 aa  101  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  35.33 
 
 		 590 aa  100  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  37.72 
 
 		 315 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.7 
 
 		 498 aa  100  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2673  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.76 
 
 		 237 aa  100  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1567  DNA-directed DNA polymerase  36.22 
 
 		 236 aa  100  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  36 
 
 		 205 aa  99.8  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0553  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.4 
 
 		 244 aa  99.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>