More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1848 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1848  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 233 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1567  DNA-directed DNA polymerase  42.79 
 
 		 236 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.32 
 
 		 769 aa  129  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1505  putative sensor with HAMP domain  41.94 
 
 		 616 aa  125  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  38.38 
 
 		 707 aa  122  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.86 
 
 		 706 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.41 
 
 		 719 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2003  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.58 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.59 
 
 		 921 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  39.8 
 
 		 584 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  34.43 
 
 		 1407 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3777  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.17 
 
 		 722 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2053  putative PAS/PAC sensor protein  34.02 
 
 		 714 aa  111  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4151  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.18 
 
 		 729 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.2 
 
 		 731 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2006  putative PAS/PAC sensor protein  36.76 
 
 		 729 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475164 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2250  hypothetical protein  32.51 
 
 		 242 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  38.02 
 
 		 566 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  31.28 
 
 		 1433 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  38.27 
 
 		 574 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3559  DNA polymerase III subunit epsilon  34.04 
 
 		 485 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0668  putative PAS/PAC sensor protein  38.12 
 
 		 719 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 		 721 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  33.52 
 
 		 1397 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  35.42 
 
 		 584 aa  103  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  37.5 
 
 		 574 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  37.11 
 
 		 570 aa  102  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.46 
 
 		 605 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.04 
 
 		 609 aa  99.4  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  32.96 
 
 		 1442 aa  99.4  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.13 
 
 		 610 aa  99.4  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.7 
 
 		 565 aa  98.6  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.6 
 
 		 595 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  35.23 
 
 		 578 aa  96.3  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  30.66 
 
 		 1367 aa  94.4  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  36.13 
 
 		 590 aa  94.4  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  30.66 
 
 		 1367 aa  94.4  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  35.42 
 
 		 630 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.48 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  35.23 
 
 		 617 aa  94  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  32.98 
 
 		 1388 aa  93.2  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2410  DNA-directed DNA polymerase  31.14 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0597525  hitchhiker  0.00000352729 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.63 
 
 		 695 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.87 
 
 		 595 aa  93.2  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  30.43 
 
 		 695 aa  92.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  34.9 
 
 		 630 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  34.9 
 
 		 630 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.95 
 
 		 695 aa  92  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  36.65 
 
 		 585 aa  91.7  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  36.41 
 
 		 601 aa  91.7  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 601 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  34.38 
 
 		 603 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  30 
 
 		 1449 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  30 
 
 		 1449 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  36.84 
 
 		 613 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02830  hypothetical protein  32.94 
 
 		 204 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  30.33 
 
 		 1365 aa  90.5  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4556  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.57 
 
 		 659 aa  90.5  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3055  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.53 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000215012  normal  0.403566 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0628  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.01 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  30.34 
 
 		 1402 aa  89.4  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  28.8 
 
 		 1465 aa  89  6e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  28.72 
 
 		 1421 aa  89  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1885  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.95 
 
 		 204 aa  88.2  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.491413  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  35.5 
 
 		 1437 aa  87.8  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.51 
 
 		 631 aa  87  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.55 
 
 		 584 aa  87.4  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  34.39 
 
 		 551 aa  86.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.9 
 
 		 921 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000241  DNA polymerase III alpha subunit  33.72 
 
 		 204 aa  86.3  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  33.51 
 
 		 616 aa  86.3  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  32.65 
 
 		 645 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2613  DNA polymerase III subunit  30.54 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  30.11 
 
 		 1426 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.73 
 
 		 956 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.04 
 
 		 498 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.73 
 
 		 927 aa  82.8  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  29.07 
 
 		 1527 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1445  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.25 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000779612  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  29.63 
 
 		 1440 aa  82.4  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2247  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.48 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000477719  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3411  DNA-directed DNA polymerase  31.14 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.537666  normal  0.0817359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.87 
 
 		 944 aa  81.6  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  29.53 
 
 		 1468 aa  81.3  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0439  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.95 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0424  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.53 
 
 		 186 aa  81.6  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  28.27 
 
 		 1390 aa  81.3  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1576  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.03 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  33.85 
 
 		 578 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1999  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.54 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4061  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.32 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.698686  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0222  exonuclease  30.54 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  30.11 
 
 		 315 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2197  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.98 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519695  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  29.71 
 
 		 315 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  29.71 
 
 		 315 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  29.78 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  30.11 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  28.33 
 
 		 1635 aa  78.2  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0024  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.54 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>