More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4029 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4029  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 
238 aa  481  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0866563  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0553  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.68 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2006  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.62 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.473172  decreased coverage  0.00101697 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0628  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.76 
 
 
239 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3933  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.63 
 
 
232 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0812308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0045  DNA polymerase III subunit epsilon  36.16 
 
 
223 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0045  DNA polymerase III subunit epsilon  37.72 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193012  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1544  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.38 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000802339  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3714  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.31 
 
 
233 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.349648  hitchhiker  0.000000325889 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.1 
 
 
706 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0553  DNA polymerase III subunit epsilon  34.5 
 
 
201 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2621  DNA polymerase III subunit epsilon  36.53 
 
 
222 aa  102  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.32 
 
 
203 aa  101  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0208649  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2477  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.03 
 
 
233 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576193 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0874  DNA polymerase III subunit epsilon  33.86 
 
 
205 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.203661  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2006  putative PAS/PAC sensor protein  35.29 
 
 
729 aa  99.8  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.475164 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.59 
 
 
719 aa  99.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0481  DNA polymerase III subunit epsilon  30.17 
 
 
220 aa  99.4  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0451  DNA polymerase III subunit epsilon  33.33 
 
 
216 aa  99  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0363772  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5959  DNA polymerase III subunit epsilon  35.84 
 
 
212 aa  99.4  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1893  DNA polymerase III subunit epsilon  36.31 
 
 
208 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598016  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0536  DNA polymerase III subunit epsilon  32.37 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0668  putative PAS/PAC sensor protein  34.2 
 
 
719 aa  96.7  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.23 
 
 
721 aa  96.3  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2503  DNA polymerase III subunit epsilon  31.32 
 
 
218 aa  96.3  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240357 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  32.46 
 
 
707 aa  95.5  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22380  DNA polymerase III subunit epsilon  35.71 
 
 
208 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000013182 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0391  DNA polymerase III subunit epsilon  31.58 
 
 
203 aa  92.4  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0160447 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0467  DNA polymerase III subunit epsilon  32.18 
 
 
216 aa  92.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.268552  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0979  DNA polymerase III subunit epsilon  32.67 
 
 
241 aa  90.9  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.102826  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.52 
 
 
769 aa  89.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1452  DNA polymerase III subunit epsilon  30 
 
 
205 aa  89.7  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0633  DNA polymerase III subunit epsilon  29.76 
 
 
209 aa  89.7  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2479  DNA polymerase III, epsilon subunit  30 
 
 
209 aa  89  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114272  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1295  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.16 
 
 
200 aa  87  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.961159  normal  0.477064 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0437  DNA polymerase III subunit epsilon  28.86 
 
 
203 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0353  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.39 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1505  putative sensor with HAMP domain  34.66 
 
 
616 aa  85.9  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2053  putative PAS/PAC sensor protein  30.93 
 
 
714 aa  85.9  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.115114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4849  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.39 
 
 
236 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1120  DNA polymerase III subunit epsilon  27.81 
 
 
207 aa  85.1  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4544  DNA polymerase III subunit epsilon  32.42 
 
 
235 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.804755  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0379  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.747837  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3777  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.87 
 
 
722 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1044  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32.95 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.69033  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0318  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.47 
 
 
267 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0836  DNA polymerase III subunit epsilon  31.52 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0381  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.02 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.738013  normal  0.331802 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  32.95 
 
 
1390 aa  83.2  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01887  DNA polymerase III subunit epsilon  31.25 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2832  DNA polymerase III subunit epsilon  27.91 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1035  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.86 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0079955 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0902  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.86 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0266  DNA polymerase III subunit epsilon  27.86 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4098  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.39 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.15 
 
 
731 aa  81.6  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3130  DNA polymerase III subunit epsilon  34.04 
 
 
240 aa  81.6  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.411931  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003140  DNA polymerase III epsilon subunit  30.11 
 
 
239 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2503  DNA polymerase III subunit epsilon  31.66 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  31.11 
 
 
1433 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  30.23 
 
 
1367 aa  79.7  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  30.23 
 
 
1367 aa  79.7  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2858  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  30.46 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0265  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  30.77 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5186  exonuclease  33.15 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.229542  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00723  putative DNA polymerase, exonuclease activity  29.17 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4151  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.21 
 
 
729 aa  78.6  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000926  DNA polymerase III epsilon subunit  31.63 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0470  exonuclease, putative  32.61 
 
 
237 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0089  exonuclease  29.5 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.289343 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  31.5 
 
 
1426 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.28 
 
 
695 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  27.32 
 
 
1397 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.41 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002200  DNA polymerase III epsilon subunit  29.41 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3137  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.32 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1525  DNA polymerase III epsilon subunit-related 3'-5' exonuclease-like protein  33.95 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.72 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  31.79 
 
 
695 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.14 
 
 
695 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1583  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.69 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.132729 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00168  DNA polymerase III subunit epsilon  29.41 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2692  DNA polymerase III subunit epsilon  29.03 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4703  exonuclease  32.42 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205144  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02456  DNA polymerase III subunit epsilon  28.98 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3752  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211189  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1752  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  29.83 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.974863  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0820  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.96 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0105  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.57 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.22 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2003  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.13 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4556  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.41 
 
 
659 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  30.27 
 
 
578 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0115  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.14 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0529  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  30.69 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.56514  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0814  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.98 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0852065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.14 
 
 
960 aa  72.8  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3347  exonuclease  31.52 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  29.35 
 
 
1444 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3835  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.66 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.999673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>