282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000926 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000926  DNA polymerase III epsilon subunit  100 
 
 		 236 aa  488  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0301  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.16 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02456  DNA polymerase III subunit epsilon  32.61 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003607  DNA polymerase III epsilon subunit  35.03 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0909  DNA polymerase III subunit epsilon  35.2 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0718919  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2503  DNA polymerase III subunit epsilon  34.78 
 
 		 251 aa  108  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0099  DNA polymerase III subunit epsilon  35.18 
 
 		 238 aa  108  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1044  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  34.08 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.69033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2322  DNA polymerase III subunit epsilon  36.14 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0721155  normal  0.012289 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0968  DNA polymerase III subunit epsilon  35.05 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1867  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.71 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.304981  normal  0.675746 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1810  DNA polymerase III subunit epsilon  35.05 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4339  DNA polymerase III subunit epsilon  31.61 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01887  DNA polymerase III subunit epsilon  35.14 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2006  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.4 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.473172  decreased coverage  0.00101697 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0836  DNA polymerase III subunit epsilon  33.18 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0050  DNA polymerase III subunit epsilon  31.98 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003140  DNA polymerase III epsilon subunit  33.7 
 
 		 239 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1525  DNA polymerase III epsilon subunit-related 3'-5' exonuclease-like protein  34.22 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4955  exonuclase  33.17 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4544  DNA polymerase III subunit epsilon  32.16 
 
 		 235 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.804755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3130  DNA polymerase III subunit epsilon  32.08 
 
 		 240 aa  92.4  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.411931  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3933  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.13 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0812308 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0266  DNA polymerase III subunit epsilon  32.81 
 
 		 240 aa  89.4  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0979  DNA polymerase III subunit epsilon  32.26 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.102826  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1713  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.1 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2671  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.62 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2834  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.43 
 
 		 226 aa  85.5  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1583  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32.06 
 
 		 228 aa  85.1  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0697497 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2636  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.14 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.815418  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2750  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.14 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.336588  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1549  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  27.75 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.418832  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0814  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.42 
 
 		 200 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0852065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1698  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.81 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1516  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  31.1 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.845972  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1752  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  29.56 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.974863  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1577  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  29.47 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160507 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4029  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.63 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0866563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0265  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  31.54 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1035  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.94 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0079955 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0553  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.45 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3835  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.89 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.999673  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0149  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.64 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1010  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.49 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0343997 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2368  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  30.43 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0245873 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2479  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.56 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114272  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1265  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.57 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1305  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.53 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3714  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.6 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.349648  hitchhiker  0.000000325889 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0816  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.53 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1295  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.88 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.961159  normal  0.477064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.33 
 
 		 595 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3694  exonuclease  28.18 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.558751  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2356  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  28.18 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1384  Rad3-related DNA helicase  29.47 
 
 		 797 aa  65.9  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0768  exonuclease  27.86 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1068  DNA polymerase III, epsilon chain  26.95 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  27.72 
 
 		 1362 aa  64.3  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  27.75 
 
 		 1367 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  27.75 
 
 		 1367 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5186  exonuclease  29.15 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.229542  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00723  putative DNA polymerase, exonuclease activity  26.88 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0820  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.86 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3752  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.67 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211189  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2477  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.16 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576193 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  27.06 
 
 		 1433 aa  62  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3823  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.16 
 
 		 200 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858387 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2855  exonuclease  32.61 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0902  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.23 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1893  DNA polymerase III subunit epsilon  27.22 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0529  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  28.06 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.56514  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1452  DNA polymerase III subunit epsilon  24.61 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  29.7 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1544  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.55 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000802339  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1583  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.06 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.132729 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.27 
 
 		 453 aa  59.3  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  29.32 
 
 		 1390 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  28.84 
 
 		 1465 aa  58.2  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3137  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.06 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0391  DNA polymerase III subunit epsilon  25.13 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0160447 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.74 
 
 		 921 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  24.86 
 
 		 590 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0437  DNA polymerase III subunit epsilon  25.13 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  25.64 
 
 		 1388 aa  56.2  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4703  exonuclease  26.82 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205144  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  26.35 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4098  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.4 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  27.12 
 
 		 1442 aa  55.1  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  25.79 
 
 		 1407 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  23.96 
 
 		 1397 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0628  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.37 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  26.23 
 
 		 584 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.74 
 
 		 934 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  28.3 
 
 		 570 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1024  exonuclease  24.24 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.747104  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05890  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.82 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0553  DNA polymerase III subunit epsilon  25.44 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164562 
 
 
-
 
NC_002620  TC0823  DNA polymerase III subunit epsilon  24.6 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.167011  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  27.27 
 
 		 954 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.7 
 
 		 921 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>