275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1698 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1698  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 228 aa  463  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2750  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  56 
 
 		 228 aa  251  7e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.336588  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2636  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  56 
 
 		 228 aa  251  7e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.815418  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2368  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  54.46 
 
 		 226 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0245873 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2671  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  55.56 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2834  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  54.02 
 
 		 226 aa  248  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1577  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  55.91 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160507 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1713  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  55.11 
 
 		 228 aa  245  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1516  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  55 
 
 		 228 aa  245  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.845972  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1583  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  54.55 
 
 		 228 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0697497 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1549  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  51.58 
 
 		 229 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.418832  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1752  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  55.05 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.974863  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2356  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  54.55 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2855  exonuclease  61.88 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1525  DNA polymerase III epsilon subunit-related 3'-5' exonuclease-like protein  50.93 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0265  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  44.44 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1044  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  36.97 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.69033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2503  DNA polymerase III subunit epsilon  39.15 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02456  DNA polymerase III subunit epsilon  36.32 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4544  DNA polymerase III subunit epsilon  36.27 
 
 		 235 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.804755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003607  DNA polymerase III epsilon subunit  32.84 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0979  DNA polymerase III subunit epsilon  34.93 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.102826  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0050  DNA polymerase III subunit epsilon  38.8 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0909  DNA polymerase III subunit epsilon  32.24 
 
 		 236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0718919  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1867  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.04 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.304981  normal  0.675746 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01887  DNA polymerase III subunit epsilon  32.59 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4339  DNA polymerase III subunit epsilon  35.75 
 
 		 236 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2322  DNA polymerase III subunit epsilon  30.94 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0721155  normal  0.012289 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0099  DNA polymerase III subunit epsilon  31.84 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3130  DNA polymerase III subunit epsilon  29.95 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.411931  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2006  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.12 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.473172  decreased coverage  0.00101697 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003140  DNA polymerase III epsilon subunit  31.25 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0968  DNA polymerase III subunit epsilon  33.17 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4955  exonuclase  31.61 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0700  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.75 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.277225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0266  DNA polymerase III subunit epsilon  32.84 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1810  DNA polymerase III subunit epsilon  32.74 
 
 		 238 aa  97.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0301  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.78 
 
 		 236 aa  96.7  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3933  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.32 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0812308 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0836  DNA polymerase III subunit epsilon  30.29 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0529  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  29.63 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.56514  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00723  putative DNA polymerase, exonuclease activity  32.42 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000926  DNA polymerase III epsilon subunit  30.81 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0816  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.14 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3835  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.77 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.999673  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0820  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.49 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4098  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.95 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3823  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.14 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858387 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0768  exonuclease  32.04 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0902  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.84 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1035  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.26 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0079955 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0814  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.97 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0852065 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3694  exonuclease  30.11 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.558751  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3752  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211189  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1265  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.98 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3714  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.91 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.349648  hitchhiker  0.000000325889 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0628  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.38 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0553  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.43 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1010  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.43 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0343997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3137  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.8 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0470  exonuclease, putative  29.48 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  31.79 
 
 		 578 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  29.71 
 
 		 584 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4029  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.78 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0866563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  29.52 
 
 		 1367 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  29.52 
 
 		 1367 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1305  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.46 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1583  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.44 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.132729 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.4 
 
 		 769 aa  65.5  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.56 
 
 		 609 aa  65.5  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1295  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.4 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.961159  normal  0.477064 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  31.67 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  29.44 
 
 		 603 aa  65.1  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4849  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.29 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  28.49 
 
 		 1362 aa  65.1  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4703  exonuclease  28.22 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0536  DNA polymerase III subunit epsilon  29.88 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  35.2 
 
 		 1402 aa  63.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  27.14 
 
 		 1390 aa  63.2  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0149  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.29 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0381  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.67 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.738013  normal  0.331802 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  29.29 
 
 		 1388 aa  62.4  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.22 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0208649  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.11 
 
 		 721 aa  62.4  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5186  exonuclease  30.3 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.229542  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.15 
 
 		 631 aa  62  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  30.11 
 
 		 578 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0379  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.06 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.747837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2477  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.65 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  28.12 
 
 		 551 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1544  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  23.81 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000802339  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0353  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.06 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  33.91 
 
 		 616 aa  59.7  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05890  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.19 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2479  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.64 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114272  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0391  DNA polymerase III subunit epsilon  25.95 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0160447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4151  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.67 
 
 		 729 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  26.51 
 
 		 1433 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0089  exonuclease  27.75 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.289343 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1452  DNA polymerase III subunit epsilon  24.26 
 
 		 205 aa  57  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>