More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3714 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3714  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 233 aa  461  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.349648  hitchhiker  0.000000325889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2006  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.78 
 
 		 233 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.473172  decreased coverage  0.00101697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3933  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.41 
 
 		 232 aa  188  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0812308 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3835  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  40.66 
 
 		 200 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.999673  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3694  exonuclease  40.11 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.558751  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1295  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.1 
 
 		 200 aa  112  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.961159  normal  0.477064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0979  DNA polymerase III subunit epsilon  39.49 
 
 		 241 aa  112  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.102826  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2503  DNA polymerase III subunit epsilon  34.26 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3752  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  39.56 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211189  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4029  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.31 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0866563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3823  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.8 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4544  DNA polymerase III subunit epsilon  36.36 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.804755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02456  DNA polymerase III subunit epsilon  32.55 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1505  putative sensor with HAMP domain  38.14 
 
 		 616 aa  105  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4955  exonuclase  30.77 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0266  DNA polymerase III subunit epsilon  37.31 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003607  DNA polymerase III epsilon subunit  32.24 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3130  DNA polymerase III subunit epsilon  34.09 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.411931  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003140  DNA polymerase III epsilon subunit  35.79 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3137  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  39.23 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.01 
 
 		 769 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0836  DNA polymerase III subunit epsilon  39.78 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0045  DNA polymerase III subunit epsilon  35.91 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193012  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0816  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.25 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0768  exonuclease  38.92 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0553  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.78 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0909  DNA polymerase III subunit epsilon  32.99 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0718919  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0628  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.37 
 
 		 239 aa  98.6  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1583  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.67 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.132729 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01887  DNA polymerase III subunit epsilon  32.41 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1452  DNA polymerase III subunit epsilon  31.82 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0820  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.38 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.99 
 
 		 721 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.17 
 
 		 719 aa  95.9  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  33.14 
 
 		 1390 aa  95.5  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.44 
 
 		 706 aa  95.1  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0099  DNA polymerase III subunit epsilon  30.52 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4151  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.81 
 
 		 729 aa  93.2  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 		 707 aa  93.6  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1044  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32.04 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.69033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  31.61 
 
 		 1433 aa  92.8  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0481  DNA polymerase III subunit epsilon  32.31 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5959  DNA polymerase III subunit epsilon  36.93 
 
 		 212 aa  92  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0814  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.04 
 
 		 200 aa  92  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0852065 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  32.8 
 
 		 1367 aa  91.7  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  32.8 
 
 		 1367 aa  91.7  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.57 
 
 		 203 aa  91.3  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0208649  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2477  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.05 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576193 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4339  DNA polymerase III subunit epsilon  29.15 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1867  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.57 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.304981  normal  0.675746 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0050  DNA polymerase III subunit epsilon  32.29 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1544  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.05 
 
 		 203 aa  89  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000802339  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0968  DNA polymerase III subunit epsilon  30.05 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0668  putative PAS/PAC sensor protein  34.17 
 
 		 719 aa  87  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1549  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  30.25 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.418832  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0045  DNA polymerase III subunit epsilon  30.68 
 
 		 223 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0301  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.19 
 
 		 236 aa  85.9  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2621  DNA polymerase III subunit epsilon  31.79 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2053  putative PAS/PAC sensor protein  32.37 
 
 		 714 aa  85.9  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115114 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2503  DNA polymerase III subunit epsilon  32.99 
 
 		 218 aa  85.1  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240357 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0874  DNA polymerase III subunit epsilon  35.33 
 
 		 205 aa  85.1  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.203661  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2006  putative PAS/PAC sensor protein  31.84 
 
 		 729 aa  84.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2368  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  29.58 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0245873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2834  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.94 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2322  DNA polymerase III subunit epsilon  29.19 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0721155  normal  0.012289 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0089  exonuclease  34.47 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.289343 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0536  DNA polymerase III subunit epsilon  30.77 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1035  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.08 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0079955 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1713  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.03 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3777  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.57 
 
 		 722 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  30.2 
 
 		 1436 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4098  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.38 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  31.94 
 
 		 1440 aa  80.1  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0553  DNA polymerase III subunit epsilon  28.25 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164562 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.96 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  31.63 
 
 		 695 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.96 
 
 		 695 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  29.95 
 
 		 1407 aa  79.7  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  30.69 
 
 		 1444 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0467  DNA polymerase III subunit epsilon  36.22 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.268552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.12 
 
 		 695 aa  79  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4849  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.02 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2750  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.57 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.336588  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2671  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.57 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2636  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.57 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.815418  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1810  DNA polymerase III subunit epsilon  29.51 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  29.9 
 
 		 1397 aa  77  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0297  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.51 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002200  DNA polymerase III epsilon subunit  27.18 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0353  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.96 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1893  DNA polymerase III subunit epsilon  31 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598016  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  34.68 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1305  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.66 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.33 
 
 		 921 aa  75.9  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  29.14 
 
 		 1449 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0105  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.36 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  29.14 
 
 		 1449 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0451  DNA polymerase III subunit epsilon  33.15 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0363772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1265  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.96 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.2 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>