More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0814 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0814  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 
200 aa  387  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0852065 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0816  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  70 
 
 
206 aa  286  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0768  exonuclease  68.16 
 
 
207 aa  277  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0820  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  67.66 
 
 
207 aa  275  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3823  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  60 
 
 
200 aa  227  8e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858387 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3835  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  57.29 
 
 
200 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.999673  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3752  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  57.29 
 
 
200 aa  218  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211189  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3694  exonuclease  56.28 
 
 
200 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.558751  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3137  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  56.12 
 
 
213 aa  204  9e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1583  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  53.06 
 
 
203 aa  191  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.132729 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1295  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  48.51 
 
 
200 aa  186  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.961159  normal  0.477064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2006  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.11 
 
 
233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.473172  decreased coverage  0.00101697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3933  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.19 
 
 
232 aa  123  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0812308 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1044  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  38.67 
 
 
230 aa  105  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.69033  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3714  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.04 
 
 
233 aa  99.4  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.349648  hitchhiker  0.000000325889 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2503  DNA polymerase III subunit epsilon  31.98 
 
 
251 aa  94.7  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4339  DNA polymerase III subunit epsilon  33.53 
 
 
236 aa  93.6  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0628  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.17 
 
 
239 aa  92  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1867  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.46 
 
 
246 aa  91.7  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.304981  normal  0.675746 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1583  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  33.33 
 
 
228 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0697497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1516  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  33.33 
 
 
228 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.845972  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1577  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  33.92 
 
 
228 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0160507 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0553  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.59 
 
 
244 aa  89  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1752  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  30.9 
 
 
228 aa  88.2  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.974863  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000926  DNA polymerase III epsilon subunit  29.32 
 
 
236 aa  86.3  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0265  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  31.76 
 
 
228 aa  85.9  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1525  DNA polymerase III epsilon subunit-related 3'-5' exonuclease-like protein  35.84 
 
 
228 aa  85.9  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0478  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.15 
 
 
184 aa  85.1  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3130  DNA polymerase III subunit epsilon  37.23 
 
 
240 aa  85.1  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.411931  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2636  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.96 
 
 
228 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.815418  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0050  DNA polymerase III subunit epsilon  32.8 
 
 
239 aa  84.7  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2750  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.96 
 
 
228 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.336588  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2671  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.92 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1698  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.97 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4955  exonuclase  29.9 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1505  putative sensor with HAMP domain  35.11 
 
 
616 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003140  DNA polymerase III epsilon subunit  33.88 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1713  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.92 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02456  DNA polymerase III subunit epsilon  32.97 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01887  DNA polymerase III subunit epsilon  32.79 
 
 
239 aa  82  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4544  DNA polymerase III subunit epsilon  33.7 
 
 
235 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.804755  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2834  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.75 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2322  DNA polymerase III subunit epsilon  31.64 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0721155  normal  0.012289 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1549  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  30.41 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.418832  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003607  DNA polymerase III epsilon subunit  31.72 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  34.04 
 
 
578 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.36 
 
 
695 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0099  DNA polymerase III subunit epsilon  31.18 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.05 
 
 
769 aa  79.3  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0045  DNA polymerase III subunit epsilon  35.53 
 
 
223 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193012  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1544  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.72 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000802339  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0700  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.53 
 
 
220 aa  77.8  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.277225  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0266  DNA polymerase III subunit epsilon  32.97 
 
 
240 aa  77.8  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2368  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32.78 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0245873 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2855  exonuclease  32.92 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.36 
 
 
695 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  36.36 
 
 
695 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0979  DNA polymerase III subunit epsilon  33.68 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.102826  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4029  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.61 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0866563  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  35.29 
 
 
613 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0668  putative PAS/PAC sensor protein  33.87 
 
 
719 aa  75.9  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2503  DNA polymerase III subunit epsilon  32.12 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2356  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  31.98 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0301  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.62 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0968  DNA polymerase III subunit epsilon  28.65 
 
 
238 aa  74.7  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2053  putative PAS/PAC sensor protein  29.19 
 
 
714 aa  74.7  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.115114 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  34.41 
 
 
584 aa  74.7  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  34.95 
 
 
578 aa  74.7  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.86 
 
 
706 aa  74.7  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0909  DNA polymerase III subunit epsilon  30.39 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0718919  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  37.59 
 
 
570 aa  73.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.27 
 
 
731 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.22 
 
 
605 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1810  DNA polymerase III subunit epsilon  30.32 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0836  DNA polymerase III subunit epsilon  32.28 
 
 
240 aa  71.2  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.81 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.6 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2006  putative PAS/PAC sensor protein  31.63 
 
 
729 aa  70.5  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.475164 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  31.12 
 
 
707 aa  70.9  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  32.26 
 
 
590 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1010  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.29 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0343997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5959  DNA polymerase III subunit epsilon  35.29 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  31.45 
 
 
1390 aa  69.3  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.32 
 
 
721 aa  68.6  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0481  DNA polymerase III subunit epsilon  30.37 
 
 
220 aa  67.8  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  26.88 
 
 
1433 aa  67.8  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.43 
 
 
595 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.23 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0208649  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  29.12 
 
 
1397 aa  67.4  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.97 
 
 
719 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  33.17 
 
 
574 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0451  DNA polymerase III subunit epsilon  32.09 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0363772  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  31.58 
 
 
617 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  35.48 
 
 
584 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.16 
 
 
610 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  34.31 
 
 
601 aa  66.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  26.8 
 
 
1440 aa  66.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00723  putative DNA polymerase, exonuclease activity  27.84 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.17 
 
 
584 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0553  DNA polymerase III subunit epsilon  30.48 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>