More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3823 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3823  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 
200 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858387 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3694  exonuclease  66.83 
 
 
200 aa  258  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.558751  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3752  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  65.83 
 
 
200 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211189  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3835  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  65.83 
 
 
200 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.999673  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0768  exonuclease  61.69 
 
 
207 aa  241  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0816  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  61 
 
 
206 aa  241  7e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0820  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  61.19 
 
 
207 aa  238  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3137  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  59.09 
 
 
213 aa  222  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0814  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  60 
 
 
200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0852065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1583  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  54.23 
 
 
203 aa  198  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.132729 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1295  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  43.59 
 
 
200 aa  161  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.961159  normal  0.477064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2006  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.41 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.473172  decreased coverage  0.00101697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3933  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.9 
 
 
232 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0812308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3714  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.8 
 
 
233 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.349648  hitchhiker  0.000000325889 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3130  DNA polymerase III subunit epsilon  39.66 
 
 
240 aa  97.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.411931  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003140  DNA polymerase III epsilon subunit  36.11 
 
 
239 aa  92.8  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4339  DNA polymerase III subunit epsilon  36.16 
 
 
236 aa  92.4  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0979  DNA polymerase III subunit epsilon  35.59 
 
 
241 aa  90.5  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.102826  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4955  exonuclase  31.87 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01887  DNA polymerase III subunit epsilon  35.71 
 
 
239 aa  90.1  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0909  DNA polymerase III subunit epsilon  34.86 
 
 
236 aa  88.2  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0718919  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2368  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  37.43 
 
 
226 aa  86.7  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0245873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4544  DNA polymerase III subunit epsilon  35.8 
 
 
235 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.804755  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02456  DNA polymerase III subunit epsilon  30.81 
 
 
249 aa  86.3  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2503  DNA polymerase III subunit epsilon  32.95 
 
 
251 aa  85.9  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003607  DNA polymerase III epsilon subunit  32.04 
 
 
248 aa  85.5  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1516  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  34.78 
 
 
228 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.845972  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1583  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  34.78 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0697497 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1549  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32.96 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.418832  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1044  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  36.76 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.69033  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0553  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.28 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0628  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.63 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0266  DNA polymerase III subunit epsilon  33.52 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0836  DNA polymerase III subunit epsilon  37.71 
 
 
240 aa  82  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2834  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.39 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2322  DNA polymerase III subunit epsilon  32.95 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0721155  normal  0.012289 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1698  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.14 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0700  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.16 
 
 
220 aa  79  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.277225  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0045  DNA polymerase III subunit epsilon  33.16 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193012  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0099  DNA polymerase III subunit epsilon  30.11 
 
 
238 aa  78.2  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1867  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.57 
 
 
246 aa  78.2  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.304981  normal  0.675746 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1752  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  33.15 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.974863  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1577  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  33.7 
 
 
228 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0160507 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.58 
 
 
769 aa  74.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0968  DNA polymerase III subunit epsilon  31.87 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.61 
 
 
706 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0668  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 
719 aa  72.4  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  28.49 
 
 
1390 aa  72  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0050  DNA polymerase III subunit epsilon  31.43 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1525  DNA polymerase III epsilon subunit-related 3'-5' exonuclease-like protein  32.99 
 
 
228 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0265  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  30.86 
 
 
228 aa  71.2  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0149  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.55 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1810  DNA polymerase III subunit epsilon  30.22 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0478  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.12 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  32.24 
 
 
578 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2750  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.15 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.336588  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2288  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.64 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521561  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1505  putative sensor with HAMP domain  33.83 
 
 
616 aa  67.4  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2671  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.15 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.71 
 
 
498 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0301  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.5 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2477  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.58 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  32.61 
 
 
578 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2636  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.15 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.815418  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1713  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.07 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1893  DNA polymerase III subunit epsilon  31.79 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598016  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1582  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.77 
 
 
176 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  31.77 
 
 
617 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0045  DNA polymerase III subunit epsilon  29.95 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2356  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32.93 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22380  DNA polymerase III subunit epsilon  29.9 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000013182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5959  DNA polymerase III subunit epsilon  34.25 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.11 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2855  exonuclease  31.9 
 
 
181 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3777  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.59 
 
 
722 aa  62.8  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2503  DNA polymerase III subunit epsilon  32.61 
 
 
218 aa  62.8  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.61 
 
 
721 aa  62.8  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0424  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.32 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2006  putative PAS/PAC sensor protein  31.09 
 
 
729 aa  62.4  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.475164 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0439  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.8 
 
 
186 aa  62  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  36.89 
 
 
613 aa  62  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000926  DNA polymerase III epsilon subunit  28.16 
 
 
236 aa  62  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1035  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.46 
 
 
232 aa  61.6  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0079955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.52 
 
 
328 aa  61.6  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0481  DNA polymerase III subunit epsilon  29.94 
 
 
220 aa  61.6  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  28.64 
 
 
1440 aa  61.2  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  25.95 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  28.57 
 
 
242 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  28.95 
 
 
1402 aa  61.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  30.77 
 
 
570 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4029  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.49 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0866563  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  36.72 
 
 
630 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0451  DNA polymerase III subunit epsilon  29.35 
 
 
216 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0363772  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1544  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.79 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000802339  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  32.64 
 
 
590 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2791  DNA polymerase III subunit epsilon  26.01 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0063034  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1278  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.75 
 
 
238 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  27.51 
 
 
707 aa  59.7  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1025  DNA polymerase III, epsilon subunit/ATP-dependent helicase DinG  26.14 
 
 
902 aa  59.3  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  30.11 
 
 
695 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>