More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1583 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1583  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 
203 aa  403  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.132729 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1295  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  56.57 
 
 
200 aa  217  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.961159  normal  0.477064 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3823  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  54.23 
 
 
200 aa  198  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858387 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0816  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  53.57 
 
 
206 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0768  exonuclease  53.3 
 
 
207 aa  187  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0820  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  52.79 
 
 
207 aa  184  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3137  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  51 
 
 
213 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3835  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  52.58 
 
 
200 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.999673  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0814  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  53.06 
 
 
200 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0852065 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3694  exonuclease  52.58 
 
 
200 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.558751  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3752  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  52.06 
 
 
200 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211189  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2006  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.5 
 
 
233 aa  116  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.473172  decreased coverage  0.00101697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3933  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.17 
 
 
232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0812308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3714  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.67 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.349648  hitchhiker  0.000000325889 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0628  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.52 
 
 
239 aa  89  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3130  DNA polymerase III subunit epsilon  38.02 
 
 
240 aa  88.2  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.411931  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003140  DNA polymerase III epsilon subunit  36.22 
 
 
239 aa  85.1  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003607  DNA polymerase III epsilon subunit  34.44 
 
 
248 aa  85.1  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4339  DNA polymerase III subunit epsilon  35.43 
 
 
236 aa  82  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0553  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.1 
 
 
244 aa  82  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1505  putative sensor with HAMP domain  34.54 
 
 
616 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0478  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0099  DNA polymerase III subunit epsilon  34.43 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02456  DNA polymerase III subunit epsilon  33.16 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4544  DNA polymerase III subunit epsilon  35.9 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.804755  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1044  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  35.05 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.69033  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.41 
 
 
719 aa  79  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0979  DNA polymerase III subunit epsilon  34.95 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.102826  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0909  DNA polymerase III subunit epsilon  36.21 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0718919  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2503  DNA polymerase III subunit epsilon  34.24 
 
 
251 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01887  DNA polymerase III subunit epsilon  32.97 
 
 
239 aa  78.6  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.55 
 
 
769 aa  78.2  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  34.54 
 
 
590 aa  77.4  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2368  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  34.76 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0245873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  32.61 
 
 
578 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0668  putative PAS/PAC sensor protein  34.32 
 
 
719 aa  77.4  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0050  DNA polymerase III subunit epsilon  31.89 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.22 
 
 
180 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2322  DNA polymerase III subunit epsilon  31.87 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0721155  normal  0.012289 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.89 
 
 
706 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  31.82 
 
 
578 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  35.57 
 
 
613 aa  75.9  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1525  DNA polymerase III epsilon subunit-related 3'-5' exonuclease-like protein  35.15 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  30.61 
 
 
645 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4029  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.69 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0866563  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2750  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.54 
 
 
228 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.336588  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2636  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.54 
 
 
228 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.815418  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  31.12 
 
 
707 aa  73.9  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1549  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  30.21 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.418832  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2671  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.02 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0968  DNA polymerase III subunit epsilon  31.52 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.81 
 
 
610 aa  73.2  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1713  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.02 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  33.33 
 
 
584 aa  73.2  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.22 
 
 
731 aa  72.8  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  28.87 
 
 
1390 aa  72.4  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1752  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  29.95 
 
 
228 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.974863  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2006  putative PAS/PAC sensor protein  31.63 
 
 
729 aa  71.6  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.475164 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.2 
 
 
695 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  32.99 
 
 
616 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  32.32 
 
 
570 aa  69.7  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0836  DNA polymerase III subunit epsilon  35.29 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2834  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.39 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1583  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32.58 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0697497 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.64 
 
 
695 aa  68.2  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0149  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.14 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  31.64 
 
 
695 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1516  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  31.46 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.845972  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  33 
 
 
605 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3559  DNA polymerase III subunit epsilon  30.41 
 
 
485 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0424  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.84 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  31.96 
 
 
601 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0439  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.84 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00723  putative DNA polymerase, exonuclease activity  31.32 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3777  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.69 
 
 
722 aa  66.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1698  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.44 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  33.5 
 
 
574 aa  65.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4955  exonuclase  27.98 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2477  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.95 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00576193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  29.03 
 
 
551 aa  65.5  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  30.21 
 
 
630 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  30.27 
 
 
1402 aa  65.1  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.47 
 
 
609 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4151  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.27 
 
 
729 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  30.21 
 
 
630 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.46 
 
 
584 aa  63.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1867  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.71 
 
 
246 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.304981  normal  0.675746 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1848  DNA-directed DNA polymerase  34.31 
 
 
233 aa  64.7  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1577  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32.6 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0160507 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  30.21 
 
 
630 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.37 
 
 
721 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  29.9 
 
 
1367 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1544  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.32 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000802339  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  29.9 
 
 
1367 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4556  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.96 
 
 
659 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0265  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  27.91 
 
 
228 aa  63.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0266  DNA polymerase III subunit epsilon  31.75 
 
 
240 aa  62.8  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  29.41 
 
 
617 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.22 
 
 
595 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  31.91 
 
 
566 aa  62.8  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.277294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>