More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2858 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2858  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 198 aa  398  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2479  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114272  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1265  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.75 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1035  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.03 
 
 		 232 aa  91.7  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0079955 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1010  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.27 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0343997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4029  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.46 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0866563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1305  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.49 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1544  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.14 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000802339  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002200  DNA polymerase III epsilon subunit  28.99 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00168  DNA polymerase III subunit epsilon  28.99 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2003  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.43 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1452  DNA polymerase III subunit epsilon  28.57 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2692  DNA polymerase III subunit epsilon  27.91 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0470  exonuclease, putative  33.33 
 
 		 237 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1120  DNA polymerase III subunit epsilon  25.43 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0353  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.99 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.15 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0208649  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4703  exonuclease  28.14 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0379  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.41 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.747837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.76 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0045  DNA polymerase III subunit epsilon  23.39 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0045  DNA polymerase III subunit epsilon  26.4 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193012  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0381  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.32 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.738013  normal  0.331802 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  31.14 
 
 		 1444 aa  68.2  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0553  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.53 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0089  exonuclease  28.24 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.289343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5186  exonuclease  25.85 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.229542  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0536  DNA polymerase III subunit epsilon  23.96 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.71 
 
 		 565 aa  66.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0628  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.7 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4849  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.76 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2503  DNA polymerase III subunit epsilon  25 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000240357 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  28.22 
 
 		 1435 aa  64.7  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05890  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5959  DNA polymerase III subunit epsilon  23.33 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22380  DNA polymerase III subunit epsilon  25.6 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000013182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1893  DNA polymerase III subunit epsilon  26.63 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598016  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2247  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.57 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000477719  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.46 
 
 		 721 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.31 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  25.44 
 
 		 1440 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  26.9 
 
 		 1436 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2137  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.22 
 
 		 864 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0398  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.01 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4098  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.37 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  23.26 
 
 		 1432 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0766  CRISPR-associated endoribonuclease Cas2  32.24 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0695815 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0451  DNA polymerase III subunit epsilon  24.16 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0363772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2053  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 		 714 aa  59.3  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115114 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2621  DNA polymerase III subunit epsilon  23.81 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0391  DNA polymerase III subunit epsilon  24.39 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0160447 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  30.41 
 
 		 1365 aa  58.5  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  26.32 
 
 		 1438 aa  58.2  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  26.32 
 
 		 1438 aa  58.2  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2250  hypothetical protein  24.74 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0423  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.22 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2465  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.52 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3714  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.08 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.349648  hitchhiker  0.000000325889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0400  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.38 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3669  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.48 
 
 		 479 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.731231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  26.29 
 
 		 1397 aa  56.6  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0564  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.38 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  26.32 
 
 		 1426 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3777  DNA polymerase III, epsilon subunit  25 
 
 		 722 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0481  DNA polymerase III subunit epsilon  24.46 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  26.49 
 
 		 1433 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  28.31 
 
 		 1388 aa  55.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  26.38 
 
 		 1433 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  26.38 
 
 		 1433 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  26.38 
 
 		 1433 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  26.38 
 
 		 1433 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2613  DNA polymerase III subunit  30.47 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  26.38 
 
 		 1433 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0158  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.22 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  26.38 
 
 		 1433 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0303  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.57 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3347  exonuclease  26.49 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  27.91 
 
 		 720 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  26.38 
 
 		 970 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0105  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.92 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0115  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.92 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  25.77 
 
 		 1433 aa  54.7  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  24.56 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  25.7 
 
 		 1367 aa  53.9  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.22 
 
 		 719 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.71 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  25.7 
 
 		 1367 aa  53.9  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  26.06 
 
 		 1433 aa  54.3  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0633  DNA polymerase III subunit epsilon  21.98 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0467  DNA polymerase III subunit epsilon  22.7 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.268552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.67 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3448  DNA polymerase III subunit epsilon  30.46 
 
 		 230 aa  53.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2071  DNA polymerase III subunit epsilon  27.81 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2288  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.14 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521561  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.36 
 
 		 921 aa  53.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0874  DNA polymerase III subunit epsilon  22.54 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.203661  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2978  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.84 
 
 		 230 aa  53.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1505  putative sensor with HAMP domain  25.9 
 
 		 616 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.45 
 
 		 706 aa  53.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1991  DNA polymerase III subunit epsilon  27.81 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>