More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1292 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1292  DNA polymerase III subunit epsilon  100 
 
 
345 aa  699    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5519  DNA polymerase III subunit epsilon  87.09 
 
 
333 aa  589  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.716069  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5268  DNA polymerase III subunit epsilon  74.46 
 
 
330 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.674728  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4989  DNA polymerase III subunit epsilon  74.46 
 
 
330 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4900  DNA polymerase III subunit epsilon  74.46 
 
 
330 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13743  DNA polymerase III subunit epsilon  68 
 
 
329 aa  444  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000832595  normal  0.511972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4913  DNA polymerase III subunit epsilon  44.48 
 
 
389 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  hitchhiker  0.00553803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.41 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35510  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  42.33 
 
 
611 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4769  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  39.6 
 
 
590 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.156881  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4419  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.02 
 
 
224 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280676  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5882  DNA polymerase III, epsilon subunit  56.82 
 
 
193 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5482  DNA polymerase III, epsilon subunit  56.82 
 
 
193 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.915048 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  40 
 
 
406 aa  119  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2943  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.95 
 
 
410 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000266032  decreased coverage  0.0000042458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3810  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  36.41 
 
 
405 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  39.52 
 
 
570 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  32.18 
 
 
217 aa  91.7  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2129  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.6 
 
 
547 aa  91.3  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165153  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  34.73 
 
 
1449 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  34.73 
 
 
1449 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.49 
 
 
196 aa  90.9  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3860  DNA polymerase III epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease-like protein  39.32 
 
 
407 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0866  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  40 
 
 
204 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.183272 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  37.34 
 
 
530 aa  90.1  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000050364  normal  0.710356 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.43 
 
 
565 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.89 
 
 
205 aa  88.2  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  30 
 
 
1440 aa  87  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.9 
 
 
456 aa  86.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5255  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.72 
 
 
180 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000603191  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3616  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.08 
 
 
530 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00210343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.94 
 
 
909 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.33 
 
 
610 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.76 
 
 
631 aa  85.9  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  35.38 
 
 
630 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  35.05 
 
 
617 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0501  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.54 
 
 
238 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.15 
 
 
236 aa  84  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  28.33 
 
 
1433 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  34.94 
 
 
578 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9062  DNA-directed DNA polymerase  40.87 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  34.87 
 
 
630 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  34.87 
 
 
630 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2482  DNA-directed DNA polymerase  35.37 
 
 
168 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2346  DNA-directed DNA polymerase  40.24 
 
 
170 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0956  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.75 
 
 
463 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2347  exonuclease  34.73 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.37 
 
 
498 aa  80.5  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  32.34 
 
 
1527 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.13 
 
 
459 aa  80.5  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2302  UvrD/REP helicase  32.34 
 
 
829 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556709  normal  0.916479 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  32.72 
 
 
1397 aa  80.1  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.54 
 
 
595 aa  80.1  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.57 
 
 
449 aa  80.1  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1662  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.95 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.862026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.11 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.7 
 
 
462 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  24.67 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  36.75 
 
 
590 aa  79.3  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7047  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  47.01 
 
 
382 aa  79.3  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2814  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.91 
 
 
243 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  33.9 
 
 
574 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0714  exonuclease  31.61 
 
 
516 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1478  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.18 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  normal  0.333081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1251  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.7 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0436  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.5 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0464133  normal  0.956681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  28.74 
 
 
1407 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1880  DNA-directed DNA polymerase  29.94 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115193  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1647  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
466 aa  77.8  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2838  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.87 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0462127 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0251  exonuclease  33.12 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1010  DNA polymerase III subunit epsilon  30.72 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.296834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.55 
 
 
934 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.72 
 
 
235 aa  77  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.12 
 
 
234 aa  77  0.0000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.55 
 
 
934 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.55 
 
 
934 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.55 
 
 
934 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  30.23 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  35.33 
 
 
574 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1383  exonuclease  39.75 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.55 
 
 
934 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  29.31 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.55 
 
 
934 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.55 
 
 
934 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  30.23 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.87 
 
 
769 aa  76.3  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  29.82 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4282  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.93 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0555283 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  25.4 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  37.93 
 
 
560 aa  76.3  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0024  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.25 
 
 
210 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13734 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0006  DNA polymerase III subunit epsilon  32.74 
 
 
236 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1582  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.03 
 
 
176 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2572  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.45 
 
 
476 aa  75.5  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0677  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.97 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0863  DNA polymerase III subunit epsilon  33.73 
 
 
265 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.63 
 
 
453 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>