More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5482 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008704  Mkms_5882  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 
193 aa  373  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5482  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 
193 aa  373  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.915048 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5268  DNA polymerase III subunit epsilon  59.54 
 
 
330 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.674728  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1292  DNA polymerase III subunit epsilon  56.82 
 
 
345 aa  200  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4989  DNA polymerase III subunit epsilon  58.96 
 
 
330 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4900  DNA polymerase III subunit epsilon  58.96 
 
 
330 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5519  DNA polymerase III subunit epsilon  56.82 
 
 
333 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.716069  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13743  DNA polymerase III subunit epsilon  58.05 
 
 
329 aa  179  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000832595  normal  0.511972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  54.86 
 
 
328 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35510  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  52.57 
 
 
611 aa  171  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4913  DNA polymerase III subunit epsilon  51.74 
 
 
389 aa  164  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  hitchhiker  0.00553803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4419  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.77 
 
 
224 aa  159  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280676  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4769  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  44.77 
 
 
590 aa  145  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.156881  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.75 
 
 
406 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.65 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.42 
 
 
196 aa  100  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2129  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.87 
 
 
547 aa  99.8  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165153  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.41 
 
 
565 aa  98.2  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3616  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.62 
 
 
530 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00210343  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.2 
 
 
462 aa  93.6  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3810  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  35 
 
 
405 aa  92  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  39.87 
 
 
530 aa  91.7  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000050364  normal  0.710356 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  39.13 
 
 
570 aa  90.1  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.94 
 
 
463 aa  90.1  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.21 
 
 
610 aa  88.6  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2943  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.02 
 
 
410 aa  88.6  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000266032  decreased coverage  0.0000042458 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1592  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  35.98 
 
 
238 aa  88.2  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2347  exonuclease  37.65 
 
 
313 aa  87.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.74 
 
 
236 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0866  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.44 
 
 
204 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.183272 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1251  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.25 
 
 
228 aa  87.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  33.53 
 
 
1440 aa  86.3  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  40.49 
 
 
630 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.75 
 
 
715 aa  85.9  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.57 
 
 
225 aa  85.5  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.04 
 
 
595 aa  85.5  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  31.1 
 
 
217 aa  85.1  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0720  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.36 
 
 
267 aa  85.1  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.387284  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  39.88 
 
 
630 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0956  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.97 
 
 
235 aa  84  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  39.88 
 
 
630 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  32.5 
 
 
1397 aa  83.6  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.5 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  31.55 
 
 
1449 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  31.55 
 
 
1449 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.75 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0714  exonuclease  37.27 
 
 
516 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  33.72 
 
 
578 aa  82.4  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2572  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.8 
 
 
476 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1339  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.93 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0133405  hitchhiker  0.000000000461521 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1941  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.71 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  33.75 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1010  DNA polymerase III subunit epsilon  31.93 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.296834  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0823  DNA polymerase III subunit epsilon  30.95 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.167011  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0262  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.13 
 
 
243 aa  82  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.9 
 
 
944 aa  81.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1278  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.8 
 
 
238 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  35.95 
 
 
1402 aa  81.6  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2814  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.74 
 
 
243 aa  81.6  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0251  exonuclease  37.58 
 
 
256 aa  81.6  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  40.24 
 
 
617 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0436  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.2 
 
 
339 aa  81.3  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0464133  normal  0.956681 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1595  DNA polymerase/helicase  41.61 
 
 
379 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700691  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2815  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.06 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0677  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.48 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0501  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.03 
 
 
459 aa  80.5  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.88 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1478  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.1 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  normal  0.333081 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2838  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.5 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0462127 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  33.12 
 
 
1367 aa  79.3  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  33.12 
 
 
1367 aa  79.3  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0076  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.13 
 
 
442 aa  79  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3135  DNA polymerase III subunit epsilon  31.55 
 
 
245 aa  79  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.530396  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0113  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.16 
 
 
230 aa  79  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1144  DNA polymerase III subunit epsilon  31.93 
 
 
245 aa  79  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0194  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.95 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0532  DNA polymerase III subunit epsilon  33.33 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.836516  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1055  DNA polymerase III subunit epsilon  30.59 
 
 
254 aa  78.2  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.328501  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  33.54 
 
 
1390 aa  78.2  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  29.41 
 
 
1433 aa  78.2  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2682  DNA polymerase III subunit epsilon  30.59 
 
 
254 aa  78.2  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1109  DNA polymerase III subunit epsilon  30.59 
 
 
254 aa  78.2  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  36.63 
 
 
590 aa  78.2  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2346  DNA-directed DNA polymerase  38.99 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1576  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.65 
 
 
219 aa  78.2  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4015  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
482 aa  78.2  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1780  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.36 
 
 
242 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3952  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.73 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0978  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.42 
 
 
280 aa  78.2  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0235504  normal  0.0652516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1848  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.44 
 
 
239 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.5 
 
 
595 aa  78.2  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0006  DNA polymerase III subunit epsilon  33.12 
 
 
236 aa  77.8  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1662  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.6 
 
 
232 aa  77.8  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.862026 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4556  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.96 
 
 
659 aa  77.8  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.55 
 
 
456 aa  77.8  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2245  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.52 
 
 
212 aa  77  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3860  DNA polymerase III epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease-like protein  35.04 
 
 
407 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3956  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.13 
 
 
502 aa  77  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2204  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.71 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000174809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>