More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3860 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3860  DNA polymerase III epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease-like protein  100 
 
 
407 aa  792    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2943  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.79 
 
 
410 aa  335  7.999999999999999e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000266032  decreased coverage  0.0000042458 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.06 
 
 
406 aa  323  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3810  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  45.54 
 
 
405 aa  295  9e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2129  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.53 
 
 
547 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7047  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  59.15 
 
 
382 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1624  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.82 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00188166  normal  0.266938 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0714  exonuclease  32.92 
 
 
516 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0866  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  42.51 
 
 
204 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.183272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.31 
 
 
328 aa  126  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4419  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.33 
 
 
224 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280676  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9062  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 
189 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35510  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  38.46 
 
 
611 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5268  DNA polymerase III subunit epsilon  37.06 
 
 
330 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.674728  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4989  DNA polymerase III subunit epsilon  36.55 
 
 
330 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4900  DNA polymerase III subunit epsilon  36.55 
 
 
330 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4769  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.72 
 
 
590 aa  103  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.156881  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.04 
 
 
453 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.52 
 
 
398 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13743  DNA polymerase III subunit epsilon  35.23 
 
 
329 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000832595  normal  0.511972 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.18 
 
 
225 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1292  DNA polymerase III subunit epsilon  34.95 
 
 
345 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1173  DNA polymerase III subunit epsilon  40 
 
 
244 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4913  DNA polymerase III subunit epsilon  39.41 
 
 
389 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  hitchhiker  0.00553803 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.46 
 
 
462 aa  99.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2036  DNA polymerase III subunit epsilon  41.18 
 
 
244 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5519  DNA polymerase III subunit epsilon  34.41 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.716069  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1495  DNA polymerase III subunit epsilon  40.59 
 
 
253 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1272  DNA polymerase III subunit epsilon  40.59 
 
 
253 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3616  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.31 
 
 
530 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00210343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1599  DNA polymerase III subunit epsilon  40.59 
 
 
253 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1465  DNA polymerase III subunit epsilon  40.59 
 
 
253 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.41 
 
 
463 aa  98.2  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1161  DNA polymerase III subunit epsilon  39.41 
 
 
244 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0597  DNA polymerase III subunit epsilon  40.59 
 
 
253 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0762  DNA polymerase III subunit epsilon  40.83 
 
 
240 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869408  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2073  DNA polymerase III subunit epsilon  37.7 
 
 
242 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  42.31 
 
 
530 aa  98.2  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000050364  normal  0.710356 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0555  DNA polymerase III subunit epsilon  40.83 
 
 
240 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0803  DNA polymerase III subunit epsilon  40 
 
 
244 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1284  DNA polymerase III subunit epsilon  40 
 
 
244 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000499827  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2791  DNA polymerase III subunit epsilon  40.24 
 
 
241 aa  97.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0063034  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1255  DNA polymerase III subunit epsilon  40 
 
 
244 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0108719  normal  0.264434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  38.65 
 
 
720 aa  97.1  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1751  DNA polymerase III subunit epsilon  36.98 
 
 
242 aa  96.3  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2347  exonuclease  40.49 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4114  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.97 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000182264  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4426  DNA polymerase III subunit epsilon  39.41 
 
 
244 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000436585  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.41 
 
 
238 aa  95.5  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1872  DNA polymerase III subunit epsilon  38.54 
 
 
242 aa  93.6  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000816139  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0827  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.03 
 
 
470 aa  93.6  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.261841  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0501  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.05 
 
 
238 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.47 
 
 
715 aa  93.2  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.32 
 
 
595 aa  93.2  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.05 
 
 
769 aa  93.2  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0966  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.62 
 
 
375 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153068  normal  0.250599 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2209  DNA polymerase III subunit epsilon  41.18 
 
 
241 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000456486  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0528  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.62 
 
 
375 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000485007  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0436  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.35 
 
 
339 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0464133  normal  0.956681 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1006  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.62 
 
 
375 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140116  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2572  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.65 
 
 
476 aa  92  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1250  DNA polymerase III subunit epsilon  38.6 
 
 
244 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687426  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.06 
 
 
239 aa  90.9  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  35.47 
 
 
239 aa  91.3  3e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2190  DNA polymerase III subunit epsilon  39.2 
 
 
240 aa  90.9  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0470  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.48 
 
 
228 aa  90.5  4e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0866  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.45 
 
 
375 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000243712  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.88 
 
 
236 aa  90.1  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.73 
 
 
532 aa  89.7  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2364  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.63 
 
 
235 aa  89.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0878  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.79 
 
 
375 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628504  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1595  DNA polymerase/helicase  38.33 
 
 
379 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700691  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1941  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.11 
 
 
253 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3956  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.62 
 
 
502 aa  89  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0867  DNA polymerase III subunit epsilon  37.43 
 
 
249 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20144  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  39.41 
 
 
242 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1384  Rad3-related DNA helicase  32.93 
 
 
797 aa  88.6  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1027  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.43 
 
 
236 aa  88.2  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.134047  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.34 
 
 
449 aa  87.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1705  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.76 
 
 
237 aa  87  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193811  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2940  exonuclease DNA polymerase III subunit epsilon  41.36 
 
 
381 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147558  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  32.54 
 
 
527 aa  86.7  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3040  DNA polymerase/helicase  41.36 
 
 
381 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476773  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3006  exonuclease DNA polymerase III subunit epsilon  41.36 
 
 
381 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00547496  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1662  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.84 
 
 
232 aa  86.3  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.862026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4282  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.97 
 
 
240 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0555283 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2874  DNA polymerase III subunit epsilon  36.84 
 
 
244 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0167654  normal  0.331291 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.01 
 
 
243 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1780  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.21 
 
 
242 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0677  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.07 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2814  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.05 
 
 
243 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2673  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.33 
 
 
237 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2449  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.48 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365574  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4061  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.96 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.698686  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1644  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.12 
 
 
237 aa  84  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264964  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0251  exonuclease  36.71 
 
 
256 aa  84  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2138  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.12 
 
 
237 aa  84  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
456 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  36.14 
 
 
954 aa  83.2  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0914  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.07 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>