More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0251 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0251  exonuclease  100 
 
 		 256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.88 
 
 		 565 aa  118  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  36.84 
 
 		 457 aa  112  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.95 
 
 		 456 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.68 
 
 		 205 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.33 
 
 		 595 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0076  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.68 
 
 		 442 aa  109  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.14 
 
 		 453 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.8 
 
 		 453 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.26 
 
 		 449 aa  102  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.73 
 
 		 715 aa  102  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  38.33 
 
 		 630 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5255  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.1 
 
 		 180 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000603191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  31.05 
 
 		 1397 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3956  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.91 
 
 		 502 aa  99  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.34 
 
 		 235 aa  99  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  37.06 
 
 		 570 aa  99  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  37.78 
 
 		 630 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  37.78 
 
 		 630 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.83 
 
 		 463 aa  98.2  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3616  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.87 
 
 		 530 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00210343  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  33.53 
 
 		 1421 aa  97.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4114  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.5 
 
 		 378 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000182264  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.73 
 
 		 769 aa  96.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0914  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.54 
 
 		 395 aa  95.9  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02830  hypothetical protein  33.52 
 
 		 204 aa  95.9  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0866  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.85 
 
 		 375 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000243712  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0878  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.54 
 
 		 375 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1647  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.16 
 
 		 466 aa  95.1  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  35.63 
 
 		 578 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3077  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.9 
 
 		 383 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  31.44 
 
 		 1365 aa  94.7  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0222  exonuclease  36.36 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  36.36 
 
 		 616 aa  94  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.54 
 
 		 398 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  35.56 
 
 		 584 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0677  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.9 
 
 		 392 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  38.24 
 
 		 566 aa  94.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.57 
 
 		 595 aa  93.2  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0780  exonuclease  30.37 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.67 
 
 		 459 aa  93.6  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  30.68 
 
 		 1442 aa  92.8  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  30 
 
 		 1447 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0827  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.94 
 
 		 470 aa  92.8  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0966  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.75 
 
 		 375 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153068  normal  0.250599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0528  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.75 
 
 		 375 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000485007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1006  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.75 
 
 		 375 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140116  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  30.18 
 
 		 1433 aa  92.4  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.9 
 
 		 462 aa  92.4  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4015  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.75 
 
 		 482 aa  92.4  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1848  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.95 
 
 		 239 aa  92.4  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1770  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.57 
 
 		 229 aa  92  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000241  DNA polymerase III alpha subunit  32.39 
 
 		 204 aa  92  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  32.77 
 
 		 720 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2410  DNA-directed DNA polymerase  35.96 
 
 		 208 aa  91.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0597525  hitchhiker  0.00000352729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2251  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.57 
 
 		 229 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.517325  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2460  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.43 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3055  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.76 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000215012  normal  0.403566 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3411  DNA-directed DNA polymerase  29.91 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.537666  normal  0.0817359 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1420  DNA-directed DNA polymerase  34.44 
 
 		 180 aa  90.5  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.178173 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2344  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.43 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2355  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.43 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  34.44 
 
 		 617 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  34.27 
 
 		 603 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1871  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.34 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235733  hitchhiker  0.000714256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.43 
 
 		 609 aa  90.1  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2245  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.02 
 
 		 212 aa  89.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  33.53 
 
 		 578 aa  89.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2003  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.43 
 
 		 208 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187406  hitchhiker  0.0000370659 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  30.59 
 
 		 1402 aa  89.4  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.6 
 
 		 584 aa  89.4  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1576  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.58 
 
 		 219 aa  89.4  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.91 
 
 		 605 aa  89  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  36.6 
 
 		 601 aa  89  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  33.97 
 
 		 530 aa  89  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000050364  normal  0.710356 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  33.54 
 
 		 315 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  28.78 
 
 		 315 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  32.22 
 
 		 1367 aa  88.6  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  36.67 
 
 		 601 aa  88.6  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  32.22 
 
 		 1367 aa  88.6  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4989  DNA polymerase III subunit epsilon  35.8 
 
 		 330 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  33.76 
 
 		 315 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  30.94 
 
 		 315 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  31.55 
 
 		 1465 aa  87.8  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2613  DNA polymerase III subunit  34.29 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  33.76 
 
 		 315 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  33.76 
 
 		 315 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1595  DNA polymerase/helicase  34.62 
 
 		 379 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700691  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5151  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.54 
 
 		 174 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4900  DNA polymerase III subunit epsilon  35.8 
 
 		 330 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  33.76 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  33.76 
 
 		 315 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  32.77 
 
 		 1444 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5268  DNA polymerase III subunit epsilon  35.19 
 
 		 330 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.674728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2656  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.9 
 
 		 456 aa  87.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.74 
 
 		 196 aa  87.4  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1885  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.76 
 
 		 204 aa  87  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.491413  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0987  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.76 
 
 		 208 aa  87  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.750211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  32.95 
 
 		 1433 aa  86.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  33.9 
 
 		 1435 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>