More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9062 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9062  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
189 aa  384  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.03 
 
 
406 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3810  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  42.14 
 
 
405 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0866  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  41.46 
 
 
204 aa  122  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.183272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2943  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36 
 
 
410 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000266032  decreased coverage  0.0000042458 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2129  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.5 
 
 
547 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3860  DNA polymerase III epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease-like protein  40 
 
 
407 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4419  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.62 
 
 
224 aa  99.8  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280676  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0930  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.58 
 
 
231 aa  96.7  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1965  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.5 
 
 
459 aa  97.1  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249813  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.11 
 
 
328 aa  94.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.51 
 
 
610 aa  94  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  38.12 
 
 
1367 aa  92  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  38.12 
 
 
1367 aa  92  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0436  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.36 
 
 
339 aa  91.3  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0464133  normal  0.956681 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4769  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.51 
 
 
590 aa  91.3  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.156881  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.9 
 
 
453 aa  90.9  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  39.1 
 
 
1449 aa  90.5  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4913  DNA polymerase III subunit epsilon  39.05 
 
 
389 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  hitchhiker  0.00553803 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  38.51 
 
 
1440 aa  90.1  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  39.1 
 
 
1449 aa  90.1  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3611  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.93 
 
 
230 aa  89  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.47 
 
 
205 aa  88.6  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  32.12 
 
 
527 aa  87.8  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1292  DNA polymerase III subunit epsilon  36.65 
 
 
345 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.06 
 
 
226 aa  87.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2673  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.66 
 
 
237 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2347  exonuclease  37.01 
 
 
313 aa  87  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.87 
 
 
532 aa  87.4  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4900  DNA polymerase III subunit epsilon  36.02 
 
 
330 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4989  DNA polymerase III subunit epsilon  36.02 
 
 
330 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5268  DNA polymerase III subunit epsilon  35.4 
 
 
330 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.674728  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2379  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.93 
 
 
237 aa  86.3  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7047  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  43.38 
 
 
382 aa  86.3  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  37.66 
 
 
1433 aa  86.3  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  39.1 
 
 
720 aa  86.3  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.82 
 
 
769 aa  86.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  34.57 
 
 
457 aa  86.7  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.94 
 
 
449 aa  86.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.8 
 
 
453 aa  86.3  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.98 
 
 
236 aa  85.9  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1763  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.33 
 
 
236 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.312232 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.43 
 
 
225 aa  85.9  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.33 
 
 
238 aa  86.3  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1381  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.1 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.348365  normal  0.0969598 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1485  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.33 
 
 
241 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00650497  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.49 
 
 
719 aa  85.1  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1751  DNA polymerase III subunit epsilon  34.97 
 
 
242 aa  85.1  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2449  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.74 
 
 
243 aa  85.1  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365574  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3448  DNA polymerase III subunit epsilon  33.13 
 
 
230 aa  85.1  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1173  DNA polymerase III subunit epsilon  34.97 
 
 
244 aa  85.1  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5519  DNA polymerase III subunit epsilon  34.78 
 
 
333 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.716069  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2656  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.71 
 
 
456 aa  84.7  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2814  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.36 
 
 
243 aa  84.3  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1478  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.54 
 
 
231 aa  84.3  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  normal  0.333081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5255  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.89 
 
 
180 aa  84.3  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000603191  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1250  DNA polymerase III subunit epsilon  34.97 
 
 
244 aa  84.3  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687426  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.69 
 
 
237 aa  84.3  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2073  DNA polymerase III subunit epsilon  34.97 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0194  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.84 
 
 
231 aa  84  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3077  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.6 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1872  DNA polymerase III subunit epsilon  36.2 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000816139  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2067  DNA polymerase III subunit epsilon  32.66 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0186052  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.97 
 
 
456 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3956  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.33 
 
 
502 aa  83.2  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.93 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1618  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.62 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.910547  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1999  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.82 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.39 
 
 
595 aa  83.2  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2184  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0859486  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0914  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.6 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2858  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.08 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.629828  normal  0.501512 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0956  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.42 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2897  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.66 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0541355  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0439  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.18 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2284  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.74 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1236  putative DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease  31.66 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2183  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.52 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536096  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1161  DNA polymerase III subunit epsilon  34.36 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0424  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.18 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2187  DNA polymerase III subunit epsilon  33.16 
 
 
252 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0867  DNA polymerase III subunit epsilon  34.36 
 
 
249 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20144  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.54 
 
 
462 aa  82  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1486  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.73 
 
 
236 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0964346 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13743  DNA polymerase III subunit epsilon  36.24 
 
 
329 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000832595  normal  0.511972 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2838  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.96 
 
 
231 aa  82  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0462127 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0839  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.43 
 
 
236 aa  81.6  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0720  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.72 
 
 
267 aa  81.6  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.387284  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1576  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.3 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.22 
 
 
706 aa  81.6  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  32.32 
 
 
239 aa  81.6  0.000000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1251  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.14 
 
 
228 aa  81.3  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2138  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.68 
 
 
237 aa  81.3  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985286 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2190  DNA polymerase III subunit epsilon  36.02 
 
 
240 aa  81.3  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  34.36 
 
 
909 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1941  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.79 
 
 
253 aa  81.3  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1644  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.68 
 
 
237 aa  81.3  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264964  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0076  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.48 
 
 
442 aa  80.9  0.000000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2036  DNA polymerase III subunit epsilon  34.36 
 
 
244 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.73 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>