More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0194 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0194  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 231 aa  479  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3448  DNA polymerase III subunit epsilon  67.54 
 
 		 230 aa  323  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1236  putative DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease  68.56 
 
 		 229 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2673  DNA polymerase III, epsilon subunit  66.81 
 
 		 237 aa  310  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2897  DNA polymerase III, epsilon subunit  68.12 
 
 		 229 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0541355  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2858  DNA polymerase III, epsilon subunit  61.41 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.629828  normal  0.501512 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1251  DNA polymerase III, epsilon subunit  60.09 
 
 		 228 aa  271  6e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0303  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.04 
 
 		 232 aa  254  7e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2815  DNA polymerase III, epsilon subunit  58.3 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.25 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0398  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.17 
 
 		 231 aa  248  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  54.35 
 
 		 235 aa  247  8e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0423  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.3 
 
 		 231 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0105  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.08 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0115  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.74 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196999  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0158  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.87 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0297  DNA polymerase III, epsilon subunit  50 
 
 		 231 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3611  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.25 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0849  DNA polymerase III subunit epsilon  50.85 
 
 		 231 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577786  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0006  DNA polymerase III subunit epsilon  50.21 
 
 		 236 aa  234  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0108  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.43 
 
 		 231 aa  231  5e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.223432  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2071  DNA polymerase III subunit epsilon  50.21 
 
 		 234 aa  231  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1991  DNA polymerase III subunit epsilon  50.21 
 
 		 234 aa  231  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1278  DNA polymerase III, epsilon subunit  49.79 
 
 		 238 aa  232  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1831  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.38 
 
 		 240 aa  228  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3213  DNA polymerase III subunit epsilon  50.63 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2978  DNA polymerase III, epsilon subunit  50 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1033  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.5 
 
 		 238 aa  218  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3939  DNA polymerase III subunit epsilon  48.96 
 
 		 245 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.945097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1486  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.88 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0964346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4282  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.44 
 
 		 240 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0555283 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4265  DNA polymerase III subunit epsilon  48.13 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.96 
 
 		 234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0113  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.9 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1485  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.61 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00650497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.21 
 
 		 238 aa  208  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1763  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.19 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.312232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5011  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.52 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2364  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.88 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  48.07 
 
 		 242 aa  204  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1827  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.88 
 
 		 237 aa  204  7e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1144  DNA polymerase III subunit epsilon  46.67 
 
 		 245 aa  203  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.54 
 
 		 243 aa  201  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2814  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.47 
 
 		 243 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3135  DNA polymerase III subunit epsilon  47.08 
 
 		 245 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.530396  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1761  DNA polymerase III, epsilon chain  46.38 
 
 		 236 aa  199  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0912  DNA polymerase III subunit epsilon  45.76 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0426  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.38 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.32865  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.46 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2838  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.83 
 
 		 231 aa  197  9e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0462127 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.15 
 
 		 239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0930  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.42 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.49 
 
 		 236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.99 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0495  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.85 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1010  DNA polymerase III subunit epsilon  44.96 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.296834  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0294  DNA polymerase III subunit epsilon  45 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0831172  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.26 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2288  DNA polymerase III, epsilon subunit  50 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3393  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.38 
 
 		 246 aa  191  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.882986  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0229  DNA polymerase III subunit epsilon  45.38 
 
 		 246 aa  191  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0164844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0218  DNA polymerase III subunit epsilon  45.38 
 
 		 243 aa  191  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00177967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0221  DNA polymerase III subunit epsilon  45.38 
 
 		 243 aa  191  9e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.777271  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0211  DNA polymerase III subunit epsilon  45.38 
 
 		 243 aa  191  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1339  hypothetical protein  41.85 
 
 		 233 aa  191  9e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1335  hypothetical protein  41.85 
 
 		 233 aa  191  9e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0227  DNA polymerase III subunit epsilon  45.38 
 
 		 243 aa  191  9e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.302916  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00208  DNA polymerase III subunit epsilon  45.38 
 
 		 243 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3450  DNA polymerase III subunit epsilon  45.38 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.258177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00213  hypothetical protein  45.38 
 
 		 243 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1941  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.96 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2682  DNA polymerase III subunit epsilon  44.07 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1705  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.92 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193811  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1109  DNA polymerase III subunit epsilon  44.07 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1055  DNA polymerase III subunit epsilon  44.07 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.328501  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0287  DNA polymerase III subunit epsilon  44.17 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.998111 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2402  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.06 
 
 		 242 aa  189  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000797972  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0302  DNA polymerase III subunit epsilon  44.17 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1478  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.59 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  normal  0.333081 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0289  DNA polymerase III subunit epsilon  44.17 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0228111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0308  DNA polymerase III subunit epsilon  44.17 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0956  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.59 
 
 		 235 aa  188  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  48.02 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0470  DNA polymerase III, epsilon subunit  50 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0501  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.81 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2187  DNA polymerase III subunit epsilon  50 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3480  DNA polymerase III subunit epsilon  42.51 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0603  DNA polymerase III subunit epsilon  43.98 
 
 		 252 aa  185  4e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1662  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.8 
 
 		 232 aa  185  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.862026 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1993  DNA-directed DNA polymerase  50.53 
 
 		 242 aa  185  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000133992  hitchhiker  0.00000148516 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0749  DNA polymerase III subunit epsilon  42.55 
 
 		 245 aa  184  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153552  normal  0.249034 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2838  DNA polymerase III subunit epsilon  43.46 
 
 		 244 aa  184  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41050  DNA polymerase III subunit epsilon  42.11 
 
 		 246 aa  184  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3711  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.8 
 
 		 257 aa  184  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0473  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.43 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.191106  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1764  DNA polymerase III subunit epsilon  51.43 
 
 		 259 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.743789  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29590  DNA polymerase III subunit epsilon  45.61 
 
 		 244 aa  182  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340517  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2067  DNA polymerase III subunit epsilon  45.71 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0186052  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2607  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.27 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000048711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2828  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.03 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.37287  normal  0.103192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>