More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2482 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2482  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
168 aa  347  5e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2346  DNA-directed DNA polymerase  52.17 
 
 
170 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1420  DNA-directed DNA polymerase  49.69 
 
 
180 aa  167  4e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.178173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1383  exonuclease  51.25 
 
 
181 aa  167  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2155  DNA-directed DNA polymerase  47.83 
 
 
180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  42.07 
 
 
1442 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3411  DNA-directed DNA polymerase  42.77 
 
 
215 aa  128  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.537666  normal  0.0817359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2251  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.77 
 
 
229 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.517325  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2245  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.17 
 
 
212 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1770  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.17 
 
 
229 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1848  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.17 
 
 
239 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.45 
 
 
565 aa  124  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  43.67 
 
 
1449 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  43.04 
 
 
1449 aa  121  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1576  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.72 
 
 
219 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4924  exonuclease  40.36 
 
 
203 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  39.88 
 
 
1433 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4061  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.1 
 
 
204 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.698686  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2114  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.76 
 
 
212 aa  117  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2613  DNA polymerase III subunit  39.26 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1445  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.76 
 
 
214 aa  115  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000779612  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4120  DNA-directed DNA polymerase  41.32 
 
 
203 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242284  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  40.74 
 
 
1407 aa  114  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3773  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.49 
 
 
204 aa  114  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.2447  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0987  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.76 
 
 
208 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.750211  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1885  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.02 
 
 
204 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.491413  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2003  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.16 
 
 
208 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187406  hitchhiker  0.0000370659 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0780  exonuclease  38.55 
 
 
203 aa  110  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1999  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.13 
 
 
215 aa  110  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  40.36 
 
 
1444 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2410  DNA-directed DNA polymerase  36.53 
 
 
208 aa  110  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0597525  hitchhiker  0.00000352729 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4300  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.14 
 
 
204 aa  110  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0011109  normal  0.487257 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3055  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.65 
 
 
218 aa  110  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000215012  normal  0.403566 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2344  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.55 
 
 
208 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6094  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.35 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0666129  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2460  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.55 
 
 
208 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275713  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1983  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.35 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4768  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.12 
 
 
203 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.392412  hitchhiker  0.00938493 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5458  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.14 
 
 
205 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4910  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.14 
 
 
205 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0387516  normal  0.918692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2355  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.55 
 
 
208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2007  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.75 
 
 
212 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5296  DNA-directed DNA polymerase  36.14 
 
 
205 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0646344 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4643  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.76 
 
 
211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0222434 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1485  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.35 
 
 
241 aa  107  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00650497  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0009  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.95 
 
 
203 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3952  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.12 
 
 
169 aa  107  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4781  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.76 
 
 
201 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426974  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4665  exonuclease, putative  36.75 
 
 
204 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.356009  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1381  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.35 
 
 
204 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.348365  normal  0.0969598 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  39.02 
 
 
1527 aa  105  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1763  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.77 
 
 
236 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.312232 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000241  DNA polymerase III alpha subunit  34.13 
 
 
204 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02830  hypothetical protein  34.13 
 
 
204 aa  105  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2197  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.93 
 
 
205 aa  104  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519695  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0049  DNA-directed DNA polymerase  39.29 
 
 
208 aa  103  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00111641  normal  0.175204 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1871  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.94 
 
 
204 aa  103  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235733  hitchhiker  0.000714256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  39.52 
 
 
570 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  39.29 
 
 
1440 aa  102  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  36.36 
 
 
1426 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1278  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.31 
 
 
238 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  40.13 
 
 
217 aa  101  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1486  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.62 
 
 
236 aa  101  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0964346 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.36 
 
 
180 aa  101  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  37.8 
 
 
1397 aa  101  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5011  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.5 
 
 
238 aa  100  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1834  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.12 
 
 
203 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.600995  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  39.16 
 
 
1435 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1251  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.1 
 
 
228 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0222  exonuclease  38.1 
 
 
227 aa  99.8  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  38.69 
 
 
1367 aa  99  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  38.69 
 
 
1367 aa  99  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0097  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.84 
 
 
211 aa  98.6  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  39.74 
 
 
584 aa  98.2  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  38.18 
 
 
1433 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  38.18 
 
 
1433 aa  97.8  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  38.18 
 
 
1433 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0024  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.48 
 
 
210 aa  97.4  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13734 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  37.58 
 
 
1433 aa  97.4  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  37.58 
 
 
1433 aa  97.4  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  37.58 
 
 
1433 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  37.58 
 
 
1433 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  37.58 
 
 
1433 aa  97.4  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  37.58 
 
 
1433 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.25 
 
 
205 aa  96.7  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  37.58 
 
 
970 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.04 
 
 
952 aa  96.7  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.18 
 
 
236 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1359  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.14 
 
 
978 aa  96.7  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.838712  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1033  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.51 
 
 
238 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785928  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.87 
 
 
921 aa  96.7  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  34.76 
 
 
1365 aa  96.3  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  40 
 
 
560 aa  95.9  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.76 
 
 
769 aa  96.3  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0470  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.61 
 
 
228 aa  95.5  3e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.93 
 
 
930 aa  95.5  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3729  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.72 
 
 
199 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  40 
 
 
610 aa  94.4  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  37.2 
 
 
1402 aa  94.4  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.82 
 
 
237 aa  94  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>