68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4553 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4553  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  100 
 
 		 114 aa  218  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4546  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  82.65 
 
 		 113 aa  130  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0525  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  78.57 
 
 		 113 aa  125  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6765  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  79.59 
 
 		 113 aa  123  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3498  putative Lsr2-like protein  76.53 
 
 		 113 aa  114  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.494087  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1245  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  78.57 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35520  hypothetical protein  52 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0788848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0330  hypothetical protein  48.51 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0572  Lsr2 protein  50.49 
 
 		 114 aa  84.3  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0856  hypothetical protein  47.32 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4991  putative Lsr2-like protein  46.53 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.916014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17040  hypothetical protein  45.1 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.482925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2977  putative Lsr2-like protein  45.92 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2868  putative Lsr2-like protein  46.94 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0722  hypothetical protein  48.48 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201789  normal  0.688196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0331  Lsr2-like protein  44.9 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2925  hypothetical protein  44.66 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.150841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3128  hypothetical protein  43.69 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000153902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0167  Lsr2-like protein  44.9 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0240  protein lsr2 precursor  44.44 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036159  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12910  hypothetical protein  52.04 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0677059  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0578  hypothetical protein  44.04 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0904277  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31950  hypothetical protein  48.98 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5649  hypothetical protein  44.9 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1860  LSR2-like protein  45.92 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2877  putative Lsr2-like protein  43.43 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6310  hypothetical protein  44.55 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24640  hypothetical protein  41.84 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3417  hypothetical protein  41 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9149  hypothetical protein  42.86 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0218  putative Lsr2-like protein  36.97 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.141946 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1774  putative Lsr2-like protein  41.84 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2975  hypothetical protein  46 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1647  iron-regulated LSR2 protein precursor  42 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214111  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0643  hypothetical protein  44 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.458695  normal  0.189817 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4843  Lsr2  48.48 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.631385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5143  Lsr2  48.48 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3406  hypothetical protein  41 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4757  Lsr2  48.48 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212965  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2248  hypothetical protein  41 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.262932  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3448  LSR2-like protein  43.88 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.326463  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2426  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000395226  normal  0.0109582 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4562  LSR2-like protein  41.41 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.282201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2972  iron-regulated LSR2 protein precursor  42.42 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4710  hypothetical protein  40.4 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4419  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4927  hypothetical protein  40.82 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1178  iron-regulated LSR2 protein precursor  40.4 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2090  hypothetical protein  39.8 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5750  hypothetical protein  39 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138689  normal  0.477611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4476  hypothetical protein  42.86 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0730  putative Lsr2-like protein  43.88 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2105  hypothetical protein  42.16 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0972155  normal  0.454752 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0465  hypothetical protein  41.84 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2670  hypothetical protein  38.24 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000070834  normal  0.0381923 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3996  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  40.86 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1429  Lsr2  44.44 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467931  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4276  hypothetical protein  38.38 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01530  hypothetical protein  34.69 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0638  protein lsr2 precursor  36.75 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0602  LSR2-like protein  38.68 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.332934  normal  0.0508474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5359  Lsr2  44.44 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8373  Lsr2 protein  38.61 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4514  hypothetical protein  37.5 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13630  iron-regulated lsr2 protein precursor  42.42 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.5800500000000003e-77  normal  0.0370238 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5452  Lsr2  38.78 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10230  hypothetical protein  40 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.837765 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13170  hypothetical protein  36.46 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0662843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2237  hypothetical protein  33.68 
 
 		 194 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>