67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0771 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0771  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  244  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2868  putative Lsr2-like protein  37.17 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4476  hypothetical protein  36.94 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9149  hypothetical protein  33.87 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2877  putative Lsr2-like protein  35.14 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2972  iron-regulated LSR2 protein precursor  40.17 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5750  hypothetical protein  37.29 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138689  normal  0.477611 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3128  hypothetical protein  38.14 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000153902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2670  hypothetical protein  37.17 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000070834  normal  0.0381923 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2426  hypothetical protein  41.32 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000395226  normal  0.0109582 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1860  LSR2-like protein  38.6 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1178  iron-regulated LSR2 protein precursor  39.32 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2977  putative Lsr2-like protein  34.51 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17040  hypothetical protein  35.83 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.482925 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1058  hypothetical protein  32.76 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2090  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0330  hypothetical protein  36.84 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3996  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  33.03 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2925  hypothetical protein  36.44 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.150841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1647  iron-regulated LSR2 protein precursor  34.55 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214111  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4546  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  33.93 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3417  hypothetical protein  32.43 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0722  hypothetical protein  34.45 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201789  normal  0.688196 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0525  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  32.14 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35520  hypothetical protein  35.34 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0788848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0730  putative Lsr2-like protein  39.32 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3448  LSR2-like protein  36.52 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.326463  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0167  Lsr2-like protein  31.53 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2248  hypothetical protein  33.62 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.262932  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8373  Lsr2 protein  30.28 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3498  putative Lsr2-like protein  34.21 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.494087  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4991  putative Lsr2-like protein  33.93 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.916014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2975  hypothetical protein  35.65 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5649  hypothetical protein  32.8 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2105  hypothetical protein  35.29 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0972155  normal  0.454752 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31950  hypothetical protein  34.23 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1774  putative Lsr2-like protein  34.23 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4175  hypothetical protein  30.77 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13170  hypothetical protein  34.51 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0662843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4710  hypothetical protein  31.25 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4419  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6310  hypothetical protein  32.76 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0856  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6765  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  31.58 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1245  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  33.33 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0578  hypothetical protein  33.88 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0904277  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0218  putative Lsr2-like protein  30.08 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.141946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4276  hypothetical protein  34.86 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4562  LSR2-like protein  33.33 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.282201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4927  hypothetical protein  33.64 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0331  Lsr2-like protein  32.76 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01530  hypothetical protein  31.53 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5452  Lsr2  35.96 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0602  LSR2-like protein  34.51 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.332934  normal  0.0508474 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0240  protein lsr2 precursor  35.51 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036159  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24640  hypothetical protein  33.94 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0465  hypothetical protein  33.04 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5143  Lsr2  36.21 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4843  Lsr2  36.21 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.631385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4757  Lsr2  36.21 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212965  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0643  hypothetical protein  30.09 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.458695  normal  0.189817 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0572  Lsr2 protein  30.25 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0638  protein lsr2 precursor  29.06 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1429  Lsr2  30.7 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467931  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12910  hypothetical protein  27.59 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0677059  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3406  hypothetical protein  29.31 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2551  hypothetical protein  53.33 
 
 		 385 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6389  hypothetical protein  46.88 
 
 		 264 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.338127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>