26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6389 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6389  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  534  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0882  hypothetical protein  41.88 
 
 		 193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7017  hypothetical protein  35.03 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7029  hypothetical protein  35.2 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0014  hypothetical protein  34.34 
 
 		 203 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3122  hypothetical protein  36.6 
 
 		 203 aa  99.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3914  hypothetical protein  32.73 
 
 		 170 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal  0.0357994 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3406  hypothetical protein  48.94 
 
 		 109 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9149  hypothetical protein  52.63 
 
 		 110 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2670  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000070834  normal  0.0381923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3645  hypothetical protein  27.01 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2868  putative Lsr2-like protein  44.44 
 
 		 110 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0742  hypothetical protein  30.19 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000536433  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0240  protein lsr2 precursor  54.05 
 
 		 111 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036159  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3417  hypothetical protein  54.29 
 
 		 111 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0218  putative Lsr2-like protein  60 
 
 		 134 aa  43.9  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.141946 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  40 
 
 		 1575 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4130  hypothetical protein  24.04 
 
 		 224 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12549  hypothetical protein  54.29 
 
 		 463 aa  43.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0306994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3136  hypothetical protein  30.77 
 
 		 70 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.479442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0525  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  48.65 
 
 		 113 aa  42.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5750  hypothetical protein  47.37 
 
 		 113 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138689  normal  0.477611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2426  hypothetical protein  45 
 
 		 112 aa  42.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000395226  normal  0.0109582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4546  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  48.57 
 
 		 113 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0856  hypothetical protein  47.22 
 
 		 119 aa  42.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4613  hypothetical protein  26.34 
 
 		 248 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.234619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>