15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0742 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0742  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  460  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000536433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4130  hypothetical protein  37.77 
 
 
224 aa  131  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4613  hypothetical protein  32.37 
 
 
248 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.234619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4794  hypothetical protein  36.41 
 
 
194 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3645  hypothetical protein  33.76 
 
 
207 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7017  hypothetical protein  31.66 
 
 
204 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7029  hypothetical protein  31.94 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3914  hypothetical protein  30.61 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal  0.0357994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0882  hypothetical protein  29.27 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3650  hypothetical protein  32.5 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3122  hypothetical protein  36.67 
 
 
203 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3095  hypothetical protein  29 
 
 
341 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0014  hypothetical protein  28.11 
 
 
203 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1656  hypothetical protein  28.1 
 
 
689 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329518  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6389  hypothetical protein  30.19 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.338127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>