13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4794 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4794  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  397  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4613  hypothetical protein  53.95 
 
 
248 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.234619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3645  hypothetical protein  54.88 
 
 
207 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3650  hypothetical protein  46.73 
 
 
190 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4130  hypothetical protein  40 
 
 
224 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0742  hypothetical protein  36.41 
 
 
224 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000536433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0882  hypothetical protein  30.39 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7029  hypothetical protein  30.1 
 
 
204 aa  74.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7017  hypothetical protein  30.3 
 
 
204 aa  71.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0014  hypothetical protein  28.35 
 
 
203 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3122  hypothetical protein  28.11 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3914  hypothetical protein  31.9 
 
 
170 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal  0.0357994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6389  hypothetical protein  25.62 
 
 
264 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.338127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>