16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4130 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4130  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4794  hypothetical protein  40 
 
 
194 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3645  hypothetical protein  43.04 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4613  hypothetical protein  39.83 
 
 
248 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.234619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0742  hypothetical protein  37.77 
 
 
224 aa  131  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000536433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7017  hypothetical protein  29.44 
 
 
204 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7029  hypothetical protein  31.02 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0014  hypothetical protein  29.15 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3122  hypothetical protein  29.77 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0882  hypothetical protein  28.04 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3650  hypothetical protein  27.14 
 
 
190 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3914  hypothetical protein  30.2 
 
 
170 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal  0.0357994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1580  hypothetical protein  39.8 
 
 
612 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0225613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3095  hypothetical protein  27.98 
 
 
341 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6389  hypothetical protein  24.04 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1656  hypothetical protein  29.14 
 
 
689 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329518  normal  0.419184 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>