10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1580 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1580  hypothetical protein  100 
 
 		 612 aa  1164    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0225613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1656  hypothetical protein  44.17 
 
 		 689 aa  332  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329518  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3366  hypothetical protein  40.17 
 
 		 714 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.500064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5446  hypothetical protein  37.03 
 
 		 574 aa  244  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3095  hypothetical protein  46.27 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4130  hypothetical protein  39.8 
 
 		 224 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7405  hypothetical protein  27.74 
 
 		 178 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3293  hypothetical protein  28.7 
 
 		 393 aa  44.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.601021  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17880  hypothetical protein  37.3 
 
 		 379 aa  44.3  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.052183  normal  0.750571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8750  hypothetical protein  34.88 
 
 		 484 aa  43.9  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>