32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2880 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2880  ERCC4 domain protein  100 
 
 		 322 aa  655    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00644974  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3806  ERCC4 domain-containing protein  56.13 
 
 		 330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5189  ERCC4 domain-containing protein  50.16 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5359  cyclic nucleotide-binding protein  52.8 
 
 		 321 aa  296  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12549  hypothetical protein  48.11 
 
 		 463 aa  288  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0306994 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1537  hypothetical protein  32.72 
 
 		 354 aa  123  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.578117  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1923  hypothetical protein  33.09 
 
 		 160 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00139334  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3788  ERCC4 domain-containing protein  33.09 
 
 		 160 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0905  hypothetical protein  30.77 
 
 		 158 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0333285  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4379  ERCC4  30.94 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  69.7 
 
 		 1348 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3128  hypothetical protein  77.78 
 
 		 116 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000153902 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  28.32 
 
 		 808 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2504  hypothetical protein  25.36 
 
 		 178 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0643  hypothetical protein  64.52 
 
 		 115 aa  47  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.458695  normal  0.189817 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2422  hypothetical protein  26.81 
 
 		 159 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3998  hypothetical protein  26.81 
 
 		 159 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00055728  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6765  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  50 
 
 		 113 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01530  hypothetical protein  51.22 
 
 		 100 aa  46.6  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0578  hypothetical protein  54.05 
 
 		 121 aa  46.2  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0904277  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2975  hypothetical protein  74.07 
 
 		 111 aa  46.2  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2925  hypothetical protein  70.37 
 
 		 116 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.150841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2437  hypothetical protein  53.85 
 
 		 1277 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250503  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4546  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  47.62 
 
 		 113 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0722  hypothetical protein  46.94 
 
 		 111 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201789  normal  0.688196 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2090  hypothetical protein  45.45 
 
 		 109 aa  43.9  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0525  putative lysyl tRNA synthetase-like protein  44.19 
 
 		 113 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35520  hypothetical protein  51.22 
 
 		 115 aa  43.5  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0788848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0856  hypothetical protein  52.94 
 
 		 119 aa  43.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  29.11 
 
 		 749 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0330  hypothetical protein  53.49 
 
 		 116 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  25.64 
 
 		 776 aa  43.1  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>