More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2830 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2928  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  96.57 
 
 		 487 aa  876    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1501  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  88.11 
 
 		 456 aa  785    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1363  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  77.63 
 
 		 472 aa  725    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3021  DEAD/DEAH box helicase domain protein  77.63 
 
 		 472 aa  725    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1254  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  77.68 
 
 		 481 aa  741    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1327  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  77.97 
 
 		 472 aa  726    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2752  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  99.78 
 
 		 461 aa  944    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1337  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  77.97 
 
 		 472 aa  728    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 461 aa  947    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3005  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.05 
 
 		 445 aa  596  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20592  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3336  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  68.71 
 
 		 429 aa  586  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0132236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3506  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  71.17 
 
 		 428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2576  DEAD/DEAH box helicase-like protein  64.13 
 
 		 422 aa  543  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2796  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.53 
 
 		 423 aa  537  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2777  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.01 
 
 		 451 aa  533  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1807  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  53.56 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.527975  normal  0.043326 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1590  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  50.95 
 
 		 455 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.62 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0919  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.15 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000178347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1022  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.56 
 
 		 435 aa  428  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0284952 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0950  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.35 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1383  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  53.56 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0886  DEAD/DEAH box helicase-like protein  55.59 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.3 
 
 		 433 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2892  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.56 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3068  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.62 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546349  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1279  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.83 
 
 		 433 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0871578 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3098  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.83 
 
 		 433 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.872049  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3241  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.83 
 
 		 433 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2988  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.3 
 
 		 433 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.83 
 
 		 433 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.56 
 
 		 433 aa  421  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1331  ATP-dependent RNA helicase RhlE  54.23 
 
 		 456 aa  411  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2447  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49.24 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  53.7 
 
 		 454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.7 
 
 		 454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.7 
 
 		 454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.7 
 
 		 454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.7 
 
 		 454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1312  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  50.6 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539045  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2419  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.97 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  53.7 
 
 		 454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.7 
 
 		 455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.7 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  52.88 
 
 		 540 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.07 
 
 		 471 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000222801  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2935  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.95 
 
 		 476 aa  404  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.44 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.44 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.44 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2510  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.44 
 
 		 455 aa  402  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.44 
 
 		 454 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.44 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.44 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1528  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.68 
 
 		 477 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.515167  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0786  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  50.24 
 
 		 411 aa  398  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456558  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.62 
 
 		 565 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  50 
 
 		 496 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.04 
 
 		 491 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  45.97 
 
 		 495 aa  398  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  53.17 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0681  ATP-dependent RNA helicase  50.24 
 
 		 420 aa  398  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.365485  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0429  putative ATP-dependent RNA helicase 1  49.28 
 
 		 418 aa  398  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.36 
 
 		 443 aa  396  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.36 
 
 		 560 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.3 
 
 		 513 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.34 
 
 		 550 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  54.42 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05443  ATP-dependent RNA helicase  47.61 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0808  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.33 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2898  ATP-dependent RNA helicase RhlE  49.21 
 
 		 451 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2810  ATP-dependent RNA helicase RhlE  49.21 
 
 		 451 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  51.99 
 
 		 452 aa  391  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.73 
 
 		 511 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  45.23 
 
 		 527 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  45.28 
 
 		 535 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  51.99 
 
 		 506 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.19 
 
 		 522 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001506  ATP-dependent RNA helicase  50.53 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000291883  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.44 
 
 		 525 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  50.39 
 
 		 445 aa  386  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.72 
 
 		 515 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.03 
 
 		 526 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  48.01 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1150  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.19 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.03 
 
 		 525 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.37 
 
 		 578 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  50.26 
 
 		 540 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.34 
 
 		 494 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1433  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.19 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.858886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.64 
 
 		 549 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.24 
 
 		 549 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1024  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.44 
 
 		 451 aa  385  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.66 
 
 		 515 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.87 
 
 		 492 aa  382  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0198  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.33 
 
 		 418 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.26 
 
 		 480 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  49.47 
 
 		 485 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  50.66 
 
 		 543 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.76 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>