44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1937 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1937  superfamily II DNA/RNA helicase  100 
 
 		 1024 aa  2119    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00156892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2194  superfamily II DNA/RNA helicase  49.22 
 
 		 1021 aa  1013    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1662  adenine specific DNA methyltransferase  37.04 
 
 		 1005 aa  676    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  36.03 
 
 		 1609 aa  580  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  35.86 
 
 		 1636 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  35.17 
 
 		 1613 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  33.8 
 
 		 1615 aa  537  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  34.65 
 
 		 1847 aa  529  1e-148  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  36.05 
 
 		 1632 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  33.11 
 
 		 1560 aa  493  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3139  helicase domain-containing protein  35.08 
 
 		 576 aa  318  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0378  helicase domain-containing protein  37.58 
 
 		 475 aa  300  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  39.52 
 
 		 1063 aa  248  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0925  adenine specific DNA methyltransferase  27.87 
 
 		 1049 aa  177  8e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00490448  normal  0.369503 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0310  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  26.42 
 
 		 1116 aa  174  9e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  36.18 
 
 		 1301 aa  164  9e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1765  hypothetical protein  31.17 
 
 		 1098 aa  158  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1196  adenine specific DNA methyltransferase  23.89 
 
 		 1059 aa  156  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000965363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0499  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  24.77 
 
 		 1047 aa  140  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3195  adenine specific DNA methyltransferase  24.28 
 
 		 1125 aa  134  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000607783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1350  hypothetical protein  38.1 
 
 		 221 aa  126  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.588656  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0340  adenine specific DNA methyltransferase  27.79 
 
 		 1064 aa  125  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0570393 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0066  hypothetical protein  39.39 
 
 		 165 aa  107  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3803  helicase-like protein  23.56 
 
 		 1176 aa  101  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230182  hitchhiker  0.00335378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2721  putative DNA methyltransferase  22.6 
 
 		 1121 aa  99  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1102  putative DNA methyltransferase  21.57 
 
 		 1100 aa  90.9  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.822518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0964  helicase domain-containing protein  38.1 
 
 		 84 aa  70.1  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.317266  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5510  putative DNA methyltransferase  20.74 
 
 		 555 aa  61.6  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113009  normal  0.19164 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  25.95 
 
 		 694 aa  50.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0961  hypothetical protein  32.56 
 
 		 110 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.298352  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4473  N-6 DNA methylase  28.04 
 
 		 567 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.844286 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.78 
 
 		 703 aa  49.7  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2746  type I restriction-modification system, M subunit  23.64 
 
 		 480 aa  47.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.453882  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  21.26 
 
 		 504 aa  47.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  23.79 
 
 		 519 aa  47.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4240  N-6 DNA methylase  28.33 
 
 		 567 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386659  hitchhiker  0.00142847 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  25.41 
 
 		 710 aa  46.2  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  25 
 
 		 489 aa  45.8  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  23.38 
 
 		 488 aa  46.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  25.54 
 
 		 505 aa  45.4  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  26.61 
 
 		 849 aa  45.4  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2725  type I restriction-modification system, M subunit  22.1 
 
 		 525 aa  45.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  36.47 
 
 		 1036 aa  44.7  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  26.47 
 
 		 633 aa  44.7  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>