32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3803 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3803  helicase-like protein  100 
 
 
1176 aa  2399    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230182  hitchhiker  0.00335378 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3195  adenine specific DNA methyltransferase  33.25 
 
 
1125 aa  515  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000607783  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0340  adenine specific DNA methyltransferase  25.83 
 
 
1064 aa  203  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0570393 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1196  adenine specific DNA methyltransferase  23.5 
 
 
1059 aa  199  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000965363  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0310  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  23.14 
 
 
1116 aa  187  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1765  hypothetical protein  28.9 
 
 
1098 aa  175  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0925  adenine specific DNA methyltransferase  23.34 
 
 
1049 aa  172  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00490448  normal  0.369503 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1102  putative DNA methyltransferase  24.01 
 
 
1100 aa  160  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.822518  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0499  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  25 
 
 
1047 aa  151  9e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  24.39 
 
 
1613 aa  115  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1937  superfamily II DNA/RNA helicase  23.56 
 
 
1024 aa  108  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00156892  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1662  adenine specific DNA methyltransferase  22.37 
 
 
1005 aa  108  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2194  superfamily II DNA/RNA helicase  22.89 
 
 
1021 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2721  putative DNA methyltransferase  29.69 
 
 
1121 aa  102  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  23.65 
 
 
1560 aa  97.8  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  22.46 
 
 
1636 aa  97.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  21.99 
 
 
1609 aa  92  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  25.39 
 
 
1632 aa  87.4  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  25.89 
 
 
1847 aa  84.7  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  26.44 
 
 
1615 aa  75.5  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  26.46 
 
 
1063 aa  65.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  29.66 
 
 
1301 aa  61.6  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  29.58 
 
 
676 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  29.58 
 
 
676 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  27.17 
 
 
573 aa  49.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5510  putative DNA methyltransferase  22.57 
 
 
555 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113009  normal  0.19164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  27.78 
 
 
792 aa  48.5  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  28.49 
 
 
908 aa  46.2  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  23.98 
 
 
1002 aa  46.2  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  24.21 
 
 
974 aa  45.4  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  28.95 
 
 
703 aa  45.1  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  22.73 
 
 
569 aa  44.7  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>