35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2721 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1102  putative DNA methyltransferase  40.16 
 
 		 1100 aa  716    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.822518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2721  putative DNA methyltransferase  100 
 
 		 1121 aa  2254    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5510  putative DNA methyltransferase  41.71 
 
 		 555 aa  390  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113009  normal  0.19164 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1196  adenine specific DNA methyltransferase  23.51 
 
 		 1059 aa  226  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000965363  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1765  hypothetical protein  25.04 
 
 		 1098 aa  198  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0925  adenine specific DNA methyltransferase  23.81 
 
 		 1049 aa  169  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00490448  normal  0.369503 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0310  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  20.99 
 
 		 1116 aa  168  4e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0340  adenine specific DNA methyltransferase  24.47 
 
 		 1064 aa  163  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0570393 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0499  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  20.33 
 
 		 1047 aa  155  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2194  superfamily II DNA/RNA helicase  22.03 
 
 		 1021 aa  123  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3195  adenine specific DNA methyltransferase  32.87 
 
 		 1125 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000607783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1937  superfamily II DNA/RNA helicase  22.6 
 
 		 1024 aa  105  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00156892  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3803  helicase-like protein  29.06 
 
 		 1176 aa  89.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230182  hitchhiker  0.00335378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1662  adenine specific DNA methyltransferase  22.11 
 
 		 1005 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  20.81 
 
 		 1560 aa  77  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  23.62 
 
 		 1847 aa  76.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  24.55 
 
 		 1613 aa  73.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  22.22 
 
 		 1609 aa  68.6  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  21.83 
 
 		 1636 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  21.54 
 
 		 1632 aa  64.3  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  25.17 
 
 		 1615 aa  62  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  31.93 
 
 		 1336 aa  50.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2332  adenine specific DNA methyltransferase  28.68 
 
 		 151 aa  50.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0118621 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  29.73 
 
 		 1301 aa  48.5  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  24.43 
 
 		 573 aa  47.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  23.32 
 
 		 1063 aa  47  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  37.5 
 
 		 1432 aa  47.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0505  type I restriction-modification system, M subunit  37.89 
 
 		 524 aa  46.2  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0378  helicase domain-containing protein  20.59 
 
 		 475 aa  45.8  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  23.25 
 
 		 489 aa  45.8  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  30.56 
 
 		 481 aa  45.8  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  25.58 
 
 		 489 aa  45.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  33.91 
 
 		 1338 aa  45.1  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  24.31 
 
 		 416 aa  45.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  32.61 
 
 		 520 aa  44.7  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>