31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1196 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0340  adenine specific DNA methyltransferase  46.68 
 
 		 1064 aa  907    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0570393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0925  adenine specific DNA methyltransferase  47.66 
 
 		 1049 aa  974    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00490448  normal  0.369503 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1765  hypothetical protein  42.55 
 
 		 1098 aa  851    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1196  adenine specific DNA methyltransferase  100 
 
 		 1059 aa  2198    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000965363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0499  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  34.68 
 
 		 1047 aa  557  1e-157  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0310  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  32.54 
 
 		 1116 aa  536  1e-150  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2721  putative DNA methyltransferase  23.63 
 
 		 1121 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3195  adenine specific DNA methyltransferase  25.41 
 
 		 1125 aa  215  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000607783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1102  putative DNA methyltransferase  23.24 
 
 		 1100 aa  205  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.822518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3803  helicase-like protein  25.06 
 
 		 1176 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230182  hitchhiker  0.00335378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2194  superfamily II DNA/RNA helicase  24.21 
 
 		 1021 aa  176  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  22.99 
 
 		 1560 aa  159  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1937  superfamily II DNA/RNA helicase  23.89 
 
 		 1024 aa  156  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00156892  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1662  adenine specific DNA methyltransferase  23.29 
 
 		 1005 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  23.78 
 
 		 1613 aa  128  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  22.55 
 
 		 1609 aa  125  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  22.11 
 
 		 1615 aa  124  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  22.62 
 
 		 1636 aa  124  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  22.87 
 
 		 1847 aa  123  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  21.48 
 
 		 1632 aa  108  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5510  putative DNA methyltransferase  21.12 
 
 		 555 aa  78.2  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113009  normal  0.19164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2332  adenine specific DNA methyltransferase  36.8 
 
 		 151 aa  74.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0118621 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3139  helicase domain-containing protein  20.74 
 
 		 576 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0378  helicase domain-containing protein  24.32 
 
 		 475 aa  70.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  32.26 
 
 		 1301 aa  62.8  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  24.18 
 
 		 1063 aa  55.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  25.08 
 
 		 1041 aa  52  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  24.13 
 
 		 974 aa  50.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  22.22 
 
 		 950 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2902  N6 adenine-specific DNA methyltransferase protein, N12 class  24.63 
 
 		 621 aa  46.2  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00367965 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  26.07 
 
 		 908 aa  45.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>