105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_E6 on replicon NC_008507
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  41.68 
 
 		 1636 aa  1250    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  42.81 
 
 		 1301 aa  768    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  42.95 
 
 		 1063 aa  860    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  100 
 
 		 1560 aa  3194    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  42.31 
 
 		 1613 aa  1242    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  39.32 
 
 		 1609 aa  1162    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  38.4 
 
 		 1615 aa  1125    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  39.09 
 
 		 1847 aa  1069    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  39.72 
 
 		 1632 aa  1166    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2194  superfamily II DNA/RNA helicase  34.73 
 
 		 1021 aa  533  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1937  superfamily II DNA/RNA helicase  33.11 
 
 		 1024 aa  493  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00156892  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1662  adenine specific DNA methyltransferase  33.3 
 
 		 1005 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3139  helicase domain-containing protein  38.13 
 
 		 576 aa  387  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0378  helicase domain-containing protein  36.86 
 
 		 475 aa  308  4.0000000000000004e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00371  hypothetical protein  33.39 
 
 		 977 aa  288  7e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00521  hypothetical protein  32.48 
 
 		 1341 aa  275  6e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00541  hypothetical protein  30.47 
 
 		 921 aa  246  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0602  helicase, putative  29.14 
 
 		 1004 aa  240  1e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5507  type III restriction enzyme, res subunit  42.8 
 
 		 301 aa  189  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769547 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0925  adenine specific DNA methyltransferase  22.29 
 
 		 1049 aa  165  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00490448  normal  0.369503 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1196  adenine specific DNA methyltransferase  22.99 
 
 		 1059 aa  159  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000965363  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0310  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  25.77 
 
 		 1116 aa  158  7e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1350  hypothetical protein  47.75 
 
 		 221 aa  156  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.588656  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0340  adenine specific DNA methyltransferase  23.75 
 
 		 1064 aa  147  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0570393 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5505  helicase-associated  30.51 
 
 		 871 aa  145  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000739697 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1765  hypothetical protein  22.39 
 
 		 1098 aa  144  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3195  adenine specific DNA methyltransferase  24.08 
 
 		 1125 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000607783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0499  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  25.57 
 
 		 1047 aa  126  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0066  hypothetical protein  41.51 
 
 		 165 aa  113  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1102  putative DNA methyltransferase  23.42 
 
 		 1100 aa  94.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.822518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3803  helicase-like protein  23.24 
 
 		 1176 aa  92.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230182  hitchhiker  0.00335378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2721  putative DNA methyltransferase  20.81 
 
 		 1121 aa  71.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  23.93 
 
 		 993 aa  71.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  21.74 
 
 		 462 aa  63.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  23.36 
 
 		 1053 aa  63.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  23.15 
 
 		 974 aa  63.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  24.22 
 
 		 949 aa  60.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  22.91 
 
 		 1149 aa  60.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  21.9 
 
 		 1348 aa  58.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  23.69 
 
 		 504 aa  57  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  23.62 
 
 		 475 aa  57  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1030  type III restriction enzyme, res subunit  22.74 
 
 		 893 aa  55.5  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0182402  normal  0.455384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  22.01 
 
 		 813 aa  55.5  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  24.1 
 
 		 848 aa  55.5  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0840  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  22.27 
 
 		 1068 aa  55.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473643  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  31.76 
 
 		 629 aa  54.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0964  helicase domain-containing protein  34.48 
 
 		 84 aa  54.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.317266  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  21.68 
 
 		 560 aa  54.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  31.86 
 
 		 946 aa  54.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  21.48 
 
 		 967 aa  54.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  23.24 
 
 		 489 aa  54.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  27.5 
 
 		 1287 aa  53.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  22.7 
 
 		 1005 aa  53.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0843  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  22.27 
 
 		 1068 aa  53.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.76009e-28 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  22.54 
 
 		 580 aa  52  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  23.61 
 
 		 586 aa  51.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  23.08 
 
 		 416 aa  51.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  21.3 
 
 		 908 aa  51.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  25.62 
 
 		 469 aa  50.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  23.43 
 
 		 586 aa  50.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  23.61 
 
 		 586 aa  50.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  23.43 
 
 		 586 aa  50.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1255  DEAD/DEAH box helicase  24.89 
 
 		 811 aa  49.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  30.59 
 
 		 385 aa  49.7  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  23.61 
 
 		 586 aa  50.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  43.14 
 
 		 813 aa  49.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  28.1 
 
 		 952 aa  49.3  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  23.31 
 
 		 613 aa  49.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  20.59 
 
 		 1418 aa  49.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0344  type I restriction-modification system, R subunit  23.64 
 
 		 770 aa  48.9  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000108762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0961  hypothetical protein  34.62 
 
 		 110 aa  48.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.298352  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  24.83 
 
 		 1077 aa  48.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  21.22 
 
 		 398 aa  48.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  25.3 
 
 		 574 aa  48.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  21.46 
 
 		 585 aa  48.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  22.5 
 
 		 606 aa  48.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  23.44 
 
 		 560 aa  47.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  22.45 
 
 		 586 aa  47.8  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0821  type III restriction protein res subunit  46.67 
 
 		 1042 aa  47.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0473136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  21.79 
 
 		 493 aa  47.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  41.18 
 
 		 815 aa  47.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  22.69 
 
 		 586 aa  47  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  22.69 
 
 		 586 aa  47  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  26.22 
 
 		 585 aa  47  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  23.84 
 
 		 560 aa  47  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  22.69 
 
 		 586 aa  47  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  23.38 
 
 		 586 aa  47  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  22.53 
 
 		 827 aa  46.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  36.76 
 
 		 581 aa  46.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  21.55 
 
 		 979 aa  46.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  22.34 
 
 		 560 aa  45.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  22.65 
 
 		 817 aa  45.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0707543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  31.4 
 
 		 1052 aa  45.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5861  type III restriction enzyme domain protein  23.09 
 
 		 810 aa  45.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  23.27 
 
 		 590 aa  45.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6047  type I restriction-modification system subunit R  24.42 
 
 		 788 aa  45.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.494965  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  28 
 
 		 583 aa  45.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3600  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.27 
 
 		 530 aa  45.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4457  EcoEI R domain protein  22.77 
 
 		 771 aa  45.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  25.25 
 
 		 698 aa  45.4  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>