178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3143 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  77.44 
 
 
1636 aa  1698    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  46.28 
 
 
1301 aa  852    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  100 
 
 
1063 aa  2212    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  43.34 
 
 
1847 aa  863    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal 
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  43.14 
 
 
1560 aa  860    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  51.31 
 
 
1613 aa  1050    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  47.84 
 
 
1609 aa  920    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  46.52 
 
 
1615 aa  902    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  50 
 
 
1632 aa  999    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00371  hypothetical protein  32.66 
 
 
977 aa  286  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00521  hypothetical protein  32.24 
 
 
1341 aa  284  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00541  hypothetical protein  32.12 
 
 
921 aa  273  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0602  helicase, putative  30.51 
 
 
1004 aa  270  1e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1937  superfamily II DNA/RNA helicase  39.52 
 
 
1024 aa  248  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00156892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2194  superfamily II DNA/RNA helicase  38.75 
 
 
1021 aa  247  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1662  adenine specific DNA methyltransferase  37.95 
 
 
1005 aa  237  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5507  type III restriction enzyme, res subunit  44.81 
 
 
301 aa  217  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000769547 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5505  helicase-associated  32.61 
 
 
871 aa  156  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000739697 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1255  DEAD/DEAH box helicase  24.72 
 
 
811 aa  84  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171092  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3225  EcoEI R domain-containing protein  25.83 
 
 
815 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376811  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3535  hypothetical protein  25.55 
 
 
815 aa  75.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.115476  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2867  EcoEI R domain-containing protein  23.81 
 
 
821 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  23.6 
 
 
809 aa  71.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1234  type III restriction enzyme, res subunit  23.23 
 
 
829 aa  71.2  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1976  EcoEI R domain-containing protein  23.14 
 
 
825 aa  71.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.411939  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1765  hypothetical protein  28.12 
 
 
1098 aa  71.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0925  adenine specific DNA methyltransferase  23.16 
 
 
1049 aa  70.1  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00490448  normal  0.369503 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0902  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit related helicase  23.93 
 
 
1113 aa  70.1  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.164801  hitchhiker  0.00000563993 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  25.83 
 
 
462 aa  70.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0843  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  24.95 
 
 
1068 aa  69.7  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.76009e-28 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0503  EcoEI R domain-containing protein  22.66 
 
 
824 aa  68.6  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000156579  normal  0.0688429 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  27.96 
 
 
817 aa  68.2  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0707543 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  26.52 
 
 
827 aa  68.6  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  22.72 
 
 
492 aa  68.2  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02070  type I restriction enzyme EcoAI R protein  24.09 
 
 
793 aa  67.4  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1134  EcoEI R domain-containing protein  23.19 
 
 
780 aa  67.4  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  22.34 
 
 
706 aa  67.8  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1432  type III restriction protein, res subunit  23.62 
 
 
1108 aa  66.6  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4614  EcoEI R domain-containing protein  23.48 
 
 
790 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000837819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3273  hypothetical protein  24.81 
 
 
776 aa  65.1  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  24.82 
 
 
824 aa  65.1  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1416  EcoEI R domain protein  24.02 
 
 
800 aa  65.1  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  26.1 
 
 
813 aa  64.7  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5861  type III restriction enzyme domain protein  22.86 
 
 
810 aa  64.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  22.98 
 
 
706 aa  64.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4740  type I restriction-modification system, R subunit  25.69 
 
 
787 aa  63.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6047  type I restriction-modification system subunit R  23.24 
 
 
788 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.494965  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3028  hypothetical protein  24.71 
 
 
796 aa  62.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194288  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0129  type III restriction protein res subunit  27.59 
 
 
846 aa  62.8  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.042937  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1283  EcoEI R domain-containing protein  21.25 
 
 
765 aa  62.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0499  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  24.81 
 
 
1047 aa  62  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0310  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  24.1 
 
 
1116 aa  62  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  24.55 
 
 
783 aa  62  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  22.06 
 
 
770 aa  61.6  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  23.69 
 
 
586 aa  61.6  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0896  type III restriction enzyme, res subunit  29.41 
 
 
845 aa  60.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  23.42 
 
 
760 aa  60.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3803  helicase-like protein  26.46 
 
 
1176 aa  60.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230182  hitchhiker  0.00335378 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  23.69 
 
 
586 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  23.69 
 
 
586 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  23.79 
 
 
974 aa  60.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  23.69 
 
 
586 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0964  helicase domain-containing protein  37.35 
 
 
84 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.317266  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  24.22 
 
 
586 aa  60.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  25.68 
 
 
475 aa  60.1  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  23.17 
 
 
732 aa  59.7  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0344  type I restriction-modification system, R subunit  19.96 
 
 
770 aa  59.7  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000108762  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  21.68 
 
 
493 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0352  EcoEI R domain-containing protein  23.49 
 
 
791 aa  59.7  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1895  EcoEI R domain-containing protein  23.72 
 
 
780 aa  59.7  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0749811  hitchhiker  0.00699891 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  23.69 
 
 
586 aa  59.7  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  21.01 
 
 
761 aa  59.7  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2499  DEAD/DEAH box helicase-like  24.12 
 
 
793 aa  59.3  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0539678  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  23.92 
 
 
586 aa  59.3  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  23.86 
 
 
586 aa  59.3  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  23.92 
 
 
586 aa  59.3  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3195  adenine specific DNA methyltransferase  23.64 
 
 
1125 aa  59.3  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000607783  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3651  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  24.74 
 
 
1126 aa  58.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.408969 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1018  type III restriction enzyme, res subunit  23.95 
 
 
769 aa  58.2  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3601  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  24.06 
 
 
1137 aa  58.2  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0683  type I restriction-modification system, R subunit  22.59 
 
 
784 aa  57.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0832  EcoEI R domain protein  22.59 
 
 
784 aa  57.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.916446  normal  0.633032 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1637  Type I site-specific deoxyribonuclease  21.54 
 
 
804 aa  57.4  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000133951  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  22.81 
 
 
907 aa  57.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  22 
 
 
1053 aa  57.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  22.32 
 
 
812 aa  57  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  23 
 
 
760 aa  56.2  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  23.01 
 
 
469 aa  56.2  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  23.15 
 
 
1287 aa  56.2  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2724  type III restriction protein res subunit  25.51 
 
 
936 aa  56.2  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0340  adenine specific DNA methyltransferase  23.2 
 
 
1064 aa  56.2  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0570393 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1196  adenine specific DNA methyltransferase  24.18 
 
 
1059 aa  55.5  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000965363  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  23.23 
 
 
586 aa  55.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  23.23 
 
 
586 aa  55.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  21.34 
 
 
899 aa  55.1  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  23.23 
 
 
586 aa  54.7  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  23.23 
 
 
586 aa  54.7  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03609  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicase  25.73 
 
 
1141 aa  54.7  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0150  type III restriction enzyme, res subunit  23.01 
 
 
860 aa  54.3  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4808  type III restriction enzyme, res subunit  22.67 
 
 
1137 aa  54.3  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.564367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>