54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1662 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1937  superfamily II DNA/RNA helicase  37.04 
 
 		 1024 aa  676    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00156892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2194  superfamily II DNA/RNA helicase  37.05 
 
 		 1021 aa  676    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1662  adenine specific DNA methyltransferase  100 
 
 		 1005 aa  2073    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  34.94 
 
 		 1636 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  34.03 
 
 		 1609 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  32.37 
 
 		 1615 aa  480  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  33.76 
 
 		 1847 aa  481  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  33.71 
 
 		 1632 aa  455  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  33.3 
 
 		 1560 aa  452  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  31.84 
 
 		 1613 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3139  helicase domain-containing protein  31.67 
 
 		 576 aa  238  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  37.95 
 
 		 1063 aa  237  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0378  helicase domain-containing protein  30.51 
 
 		 475 aa  205  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  37.14 
 
 		 1301 aa  164  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1765  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1098 aa  159  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1196  adenine specific DNA methyltransferase  23.29 
 
 		 1059 aa  151  5e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000965363  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0310  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  25.72 
 
 		 1116 aa  146  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0499  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  24.73 
 
 		 1047 aa  144  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0964  helicase domain-containing protein  77.38 
 
 		 84 aa  139  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.317266  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0340  adenine specific DNA methyltransferase  23.41 
 
 		 1064 aa  138  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0570393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0961  hypothetical protein  62.39 
 
 		 110 aa  131  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.298352  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0925  adenine specific DNA methyltransferase  23.54 
 
 		 1049 aa  131  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00490448  normal  0.369503 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3195  adenine specific DNA methyltransferase  23.78 
 
 		 1125 aa  121  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000607783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1350  hypothetical protein  34.54 
 
 		 221 aa  114  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.588656  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1102  putative DNA methyltransferase  21.86 
 
 		 1100 aa  107  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.822518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3803  helicase-like protein  22.25 
 
 		 1176 aa  102  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230182  hitchhiker  0.00335378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2721  putative DNA methyltransferase  20.96 
 
 		 1121 aa  84  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0066  hypothetical protein  28.66 
 
 		 165 aa  69.3  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25 
 
 		 703 aa  64.7  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0269  N-6 DNA methylase  24.78 
 
 		 519 aa  60.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2498  type I restriction-modification system, M subunit  26.55 
 
 		 488 aa  56.2  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.095428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  25 
 
 		 502 aa  52  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  21.24 
 
 		 481 aa  51.6  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  21.74 
 
 		 481 aa  51.2  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0353  N-6 DNA methylase  25.66 
 
 		 488 aa  51.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.9 
 
 		 676 aa  49.7  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  25.5 
 
 		 974 aa  49.7  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  23.51 
 
 		 477 aa  49.7  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  21.39 
 
 		 484 aa  49.7  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  19.46 
 
 		 481 aa  49.3  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  23.36 
 
 		 710 aa  48.1  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  24.05 
 
 		 493 aa  48.1  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  23.39 
 
 		 908 aa  47.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  23.72 
 
 		 694 aa  47.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  25 
 
 		 489 aa  47  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  26.56 
 
 		 1132 aa  46.2  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0684  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 489 aa  46.2  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0833  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 489 aa  46.2  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.564652 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  32.18 
 
 		 485 aa  46.2  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 489 aa  45.4  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  26.56 
 
 		 492 aa  45.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  24.58 
 
 		 490 aa  45.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  26.27 
 
 		 489 aa  44.7  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  24.92 
 
 		 568 aa  44.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>