267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_00371 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_00521  hypothetical protein  52.32 
 
 		 1341 aa  907    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00371  hypothetical protein  100 
 
 		 977 aa  1991    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00541  hypothetical protein  44.08 
 
 		 921 aa  706    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0602  helicase, putative  35.93 
 
 		 1004 aa  560  1e-158  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  34.48 
 
 		 1301 aa  360  8e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  34.62 
 
 		 1613 aa  346  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  34.09 
 
 		 1615 aa  345  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  32.89 
 
 		 1609 aa  344  5.999999999999999e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  34.58 
 
 		 1636 aa  341  4e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  32.62 
 
 		 1632 aa  340  9.999999999999999e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  33.44 
 
 		 1847 aa  331  4e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  33.18 
 
 		 1063 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  33.65 
 
 		 1560 aa  313  6.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5505  helicase-associated  27.54 
 
 		 871 aa  248  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000739697 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5507  type III restriction enzyme, res subunit  37.12 
 
 		 301 aa  168  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769547 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1604  helicase-associated  21.91 
 
 		 1256 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46291  predicted protein  26.91 
 
 		 501 aa  83.2  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  22.68 
 
 		 1149 aa  80.5  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15859  predicted protein  31.09 
 
 		 200 aa  77.8  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575833  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_6725  predicted protein  29.17 
 
 		 168 aa  77  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  24.01 
 
 		 706 aa  74.7  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  23.54 
 
 		 812 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  22.66 
 
 		 813 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  24.83 
 
 		 761 aa  70.5  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  24.32 
 
 		 586 aa  68.6  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  22.68 
 
 		 1053 aa  68.6  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  21.58 
 
 		 953 aa  68.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  21.58 
 
 		 953 aa  68.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  23.32 
 
 		 813 aa  67.8  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  21.38 
 
 		 993 aa  67.8  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  24.07 
 
 		 586 aa  67.8  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  24.07 
 
 		 586 aa  67.8  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  24.07 
 
 		 586 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  23.99 
 
 		 783 aa  67.8  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  24.07 
 
 		 586 aa  67  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  24.07 
 
 		 586 aa  67.8  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  23.83 
 
 		 586 aa  67  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  24.07 
 
 		 586 aa  67  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  24.08 
 
 		 586 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  24.07 
 
 		 586 aa  67  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  24.08 
 
 		 586 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  24.08 
 
 		 586 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2877  type III restriction protein res subunit  24.8 
 
 		 1137 aa  67  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49663  predicted protein  27.32 
 
 		 567 aa  65.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  24.08 
 
 		 586 aa  66.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4614  EcoEI R domain-containing protein  23.1 
 
 		 790 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000837819 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  23.79 
 
 		 385 aa  66.2  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  24.08 
 
 		 586 aa  66.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4712  type III restriction enzyme, res subunit  24.31 
 
 		 1137 aa  65.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  23.04 
 
 		 824 aa  65.9  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4808  type III restriction enzyme, res subunit  24.31 
 
 		 1137 aa  65.5  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.564367  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  22.14 
 
 		 1287 aa  65.5  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1283  EcoEI R domain-containing protein  24.36 
 
 		 765 aa  65.1  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  20.79 
 
 		 938 aa  64.7  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  20.75 
 
 		 946 aa  64.7  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  22.06 
 
 		 797 aa  64.3  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  25.68 
 
 		 586 aa  63.9  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38634  predicted protein  26.95 
 
 		 146 aa  63.9  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.644785  normal  0.402408 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  20.91 
 
 		 974 aa  63.5  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  23.89 
 
 		 585 aa  63.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2125  Type III restriction enzyme, res subunit  25.49 
 
 		 842 aa  63.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  23.09 
 
 		 494 aa  63.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6047  type I restriction-modification system subunit R  23.64 
 
 		 788 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.494965  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  24.23 
 
 		 787 aa  63.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0503  EcoEI R domain-containing protein  22.62 
 
 		 824 aa  63.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000156579  normal  0.0688429 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  23.66 
 
 		 815 aa  63.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1134  EcoEI R domain-containing protein  22.25 
 
 		 780 aa  63.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  23.94 
 
 		 586 aa  62.8  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2990  EcoEI R domain protein  26.54 
 
 		 875 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2867  EcoEI R domain-containing protein  25.9 
 
 		 821 aa  62.4  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0896  type III restriction enzyme, res subunit  22.95 
 
 		 845 aa  62.4  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  24.81 
 
 		 584 aa  62.4  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  22.9 
 
 		 949 aa  62.4  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  20.83 
 
 		 952 aa  62  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  22.01 
 
 		 1029 aa  61.6  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  26.59 
 
 		 770 aa  61.6  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  23.94 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4740  type I restriction-modification system, R subunit  22.48 
 
 		 787 aa  61.2  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141278 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  22.38 
 
 		 979 aa  61.2  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1416  EcoEI R domain protein  23.11 
 
 		 800 aa  61.6  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  23.58 
 
 		 1041 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  24.83 
 
 		 899 aa  60.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_6732  predicted protein  24.85 
 
 		 165 aa  60.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.798626  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1234  type III restriction enzyme, res subunit  26.77 
 
 		 829 aa  61.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  23.57 
 
 		 591 aa  60.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2963  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  23.37 
 
 		 1167 aa  60.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1895  EcoEI R domain-containing protein  23.17 
 
 		 780 aa  60.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0749811  hitchhiker  0.00699891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  22.68 
 
 		 1043 aa  60.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  22.75 
 
 		 817 aa  60.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0707543 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  24.05 
 
 		 585 aa  60.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43489  predicted protein  22.95 
 
 		 425 aa  60.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0573784  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  24.27 
 
 		 905 aa  60.1  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1030  type III restriction enzyme, res subunit  22.89 
 
 		 893 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0182402  normal  0.455384 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0307  Type III restriction enzyme, res subunit  25.53 
 
 		 539 aa  60.1  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0435132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  24.05 
 
 		 585 aa  60.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  24.05 
 
 		 585 aa  60.1  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  22.14 
 
 		 1077 aa  59.7  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  21.77 
 
 		 585 aa  60.1  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3225  EcoEI R domain-containing protein  23.54 
 
 		 815 aa  60.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  22.75 
 
 		 827 aa  59.3  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>