246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_00521 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_00521  hypothetical protein  100 
 
 		 1341 aa  2708    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00371  hypothetical protein  52.32 
 
 		 977 aa  891    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00541  hypothetical protein  47.37 
 
 		 921 aa  784    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0602  helicase, putative  36.39 
 
 		 1004 aa  632  1e-179  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  34.02 
 
 		 1613 aa  347  8e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  33.01 
 
 		 1847 aa  345  4e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  33.43 
 
 		 1301 aa  338  5e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  34.87 
 
 		 1609 aa  331  7e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  31.67 
 
 		 1632 aa  328  5e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  33.18 
 
 		 1636 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  33.49 
 
 		 1615 aa  313  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  32.39 
 
 		 1063 aa  308  6e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  32.48 
 
 		 1560 aa  294  6e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1604  helicase-associated  23.84 
 
 		 1256 aa  263  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5505  helicase-associated  27.09 
 
 		 871 aa  244  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000739697 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5507  type III restriction enzyme, res subunit  35.36 
 
 		 301 aa  144  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769547 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46291  predicted protein  27.27 
 
 		 501 aa  123  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49663  predicted protein  32.34 
 
 		 567 aa  104  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43867  predicted protein  29.07 
 
 		 485 aa  101  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0425641  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6300  predicted protein  30.98 
 
 		 195 aa  97.8  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15859  predicted protein  30.65 
 
 		 200 aa  91.7  9e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575833  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44572  predicted protein  26.21 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.709299  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  23.48 
 
 		 952 aa  78.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43902  predicted protein  36 
 
 		 1416 aa  78.2  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.279249  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_6725  predicted protein  30.3 
 
 		 168 aa  78.2  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45516  predicted protein  28.71 
 
 		 349 aa  77.8  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36794  predicted protein  32.64 
 
 		 349 aa  76.6  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42568  predicted protein  32.26 
 
 		 499 aa  75.5  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13230  predicted protein  28.08 
 
 		 152 aa  74.7  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00796928  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38634  predicted protein  36.36 
 
 		 146 aa  74.3  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.644785  normal  0.402408 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  23.87 
 
 		 1053 aa  72.8  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_6732  predicted protein  28.92 
 
 		 165 aa  72.4  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.798626  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1255  DEAD/DEAH box helicase  23.4 
 
 		 811 aa  72  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3225  EcoEI R domain-containing protein  25.23 
 
 		 815 aa  72  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3535  hypothetical protein  25.41 
 
 		 815 aa  72  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.115476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42569  predicted protein  31.79 
 
 		 427 aa  71.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.191925  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  24.29 
 
 		 1149 aa  70.5  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  22.43 
 
 		 974 aa  70.1  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16063  predicted protein  34.11 
 
 		 134 aa  70.1  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0344  type I restriction-modification system, R subunit  24.61 
 
 		 770 aa  69.7  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000108762  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49763  predicted protein  29.66 
 
 		 594 aa  68.9  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0896  type III restriction enzyme, res subunit  24.54 
 
 		 845 aa  68.6  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  26.95 
 
 		 813 aa  67.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  23.72 
 
 		 827 aa  67  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1895  EcoEI R domain-containing protein  22.84 
 
 		 780 aa  66.6  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0749811  hitchhiker  0.00699891 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  26.56 
 
 		 385 aa  66.6  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02070  type I restriction enzyme EcoAI R protein  22.74 
 
 		 793 aa  65.9  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  23.42 
 
 		 817 aa  65.9  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0707543 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48597  predicted protein  33.33 
 
 		 548 aa  65.1  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.100939  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  23.68 
 
 		 585 aa  65.1  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  25.32 
 
 		 583 aa  64.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2125  Type III restriction enzyme, res subunit  24.07 
 
 		 842 aa  65.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  25.36 
 
 		 812 aa  65.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  25.26 
 
 		 1029 aa  64.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4267  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  24.9 
 
 		 1188 aa  63.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  23.04 
 
 		 949 aa  63.5  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  25.48 
 
 		 586 aa  63.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  25.32 
 
 		 583 aa  63.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  24.24 
 
 		 1061 aa  63.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  22.86 
 
 		 1055 aa  62.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  23.58 
 
 		 783 aa  62.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  24.06 
 
 		 590 aa  62.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  22.86 
 
 		 1055 aa  62.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  22.86 
 
 		 1055 aa  62.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  23.81 
 
 		 1017 aa  62  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46014  predicted protein  24.3 
 
 		 588 aa  62  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  21.99 
 
 		 946 aa  62  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2499  DEAD/DEAH box helicase-like  24.17 
 
 		 793 aa  62  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0539678  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2963  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  24.48 
 
 		 1167 aa  62  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  24.68 
 
 		 574 aa  61.6  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3671  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  23.21 
 
 		 1174 aa  61.6  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  24.11 
 
 		 993 aa  61.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  22.41 
 
 		 982 aa  61.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3028  hypothetical protein  23.44 
 
 		 796 aa  60.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194288  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  23.15 
 
 		 824 aa  61.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5861  type III restriction enzyme domain protein  23.4 
 
 		 810 aa  61.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0352  EcoEI R domain-containing protein  24.23 
 
 		 791 aa  61.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  22.36 
 
 		 706 aa  60.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  23.29 
 
 		 949 aa  60.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43489  predicted protein  22.37 
 
 		 425 aa  60.1  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0573784  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  22.46 
 
 		 967 aa  60.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  23.74 
 
 		 967 aa  60.1  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1976  EcoEI R domain-containing protein  23.22 
 
 		 825 aa  60.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.411939  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  26.37 
 
 		 1051 aa  59.7  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3077  type III restriction protein res subunit  21.19 
 
 		 980 aa  60.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  22.59 
 
 		 494 aa  59.3  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2724  type III restriction protein res subunit  24.34 
 
 		 936 aa  59.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  31.69 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2867  EcoEI R domain-containing protein  22.45 
 
 		 821 aa  59.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  23.27 
 
 		 953 aa  58.9  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  23.27 
 
 		 953 aa  58.9  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1098  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  25.23 
 
 		 1124 aa  58.9  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  23.11 
 
 		 1043 aa  58.5  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  25.91 
 
 		 848 aa  58.5  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  21.89 
 
 		 979 aa  58.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6047  type I restriction-modification system subunit R  22.7 
 
 		 788 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.494965  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0503  EcoEI R domain-containing protein  22.54 
 
 		 824 aa  57.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000156579  normal  0.0688429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1283  EcoEI R domain-containing protein  22.04 
 
 		 765 aa  57.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  22.95 
 
 		 761 aa  57.8  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  26.09 
 
 		 770 aa  57.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>