85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4050 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4050  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 453 aa  939    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0396258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00119  Type III restriction enzyme, res subunit  38.89 
 
 		 744 aa  325  7e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.431054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  30.04 
 
 		 706 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  27.27 
 
 		 732 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  27.07 
 
 		 696 aa  144  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  29.25 
 
 		 715 aa  142  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  26.2 
 
 		 707 aa  137  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  27.51 
 
 		 706 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  36.81 
 
 		 469 aa  120  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  36.07 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  35.75 
 
 		 489 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  35.75 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  35.56 
 
 		 493 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  32.4 
 
 		 698 aa  104  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  30.54 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  33.53 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3178  type III restriction protein res subunit  26.7 
 
 		 249 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  26.92 
 
 		 1065 aa  67.4  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  26.92 
 
 		 1065 aa  67.4  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  29.09 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  27.98 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  29.09 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  27.75 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4564  helicase-like  32.3 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  26.6 
 
 		 551 aa  59.7  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  26.79 
 
 		 647 aa  56.6  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  27.27 
 
 		 531 aa  55.8  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  24.86 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0602  helicase, putative  28.85 
 
 		 1004 aa  55.5  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  27.27 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  23.12 
 
 		 466 aa  53.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  29.88 
 
 		 451 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  28.22 
 
 		 451 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  25.51 
 
 		 886 aa  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  29.27 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  26.22 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  37.1 
 
 		 468 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  28.07 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  26.4 
 
 		 998 aa  51.6  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  29.56 
 
 		 977 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  24.48 
 
 		 1031 aa  51.2  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1055  SNF2-related protein  28.92 
 
 		 452 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1075  SNF2-related protein  28.92 
 
 		 452 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.6 
 
 		 1069 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  23.3 
 
 		 491 aa  50.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  29.82 
 
 		 964 aa  50.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  29.34 
 
 		 1070 aa  50.1  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  24.21 
 
 		 650 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  22.92 
 
 		 654 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  35.94 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00541  hypothetical protein  27.57 
 
 		 921 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  30.23 
 
 		 1068 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  24.7 
 
 		 920 aa  47.4  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.81 
 
 		 633 aa  47.4  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  26.79 
 
 		 898 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  25.41 
 
 		 1110 aa  47  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  28.14 
 
 		 1250 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  28.16 
 
 		 1071 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  25.34 
 
 		 778 aa  46.6  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  24.28 
 
 		 796 aa  46.6  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  25.57 
 
 		 652 aa  46.2  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  28.92 
 
 		 549 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  28.86 
 
 		 1613 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  26.79 
 
 		 1108 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  31.58 
 
 		 1082 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  26.4 
 
 		 590 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  27.47 
 
 		 1066 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  23.95 
 
 		 1152 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  25.44 
 
 		 630 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.65 
 
 		 1007 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62265  snf family helicase  29.48 
 
 		 1557 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.510209 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  24.73 
 
 		 773 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  24.73 
 
 		 663 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  31.58 
 
 		 1082 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  25.15 
 
 		 1080 aa  44.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  31.58 
 
 		 1082 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  26.63 
 
 		 536 aa  43.9  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  27.32 
 
 		 463 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1155 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  24.26 
 
 		 649 aa  43.9  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  25.99 
 
 		 1081 aa  43.5  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  24.26 
 
 		 1150 aa  43.5  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.27 
 
 		 1261 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  30.65 
 
 		 479 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  26.38 
 
 		 658 aa  43.1  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>