More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF02840 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  978    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  68.59 
 
 		 687 aa  634  1e-180  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  67.69 
 
 		 500 aa  625  1e-178  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  64.3 
 
 		 488 aa  577  1.0000000000000001e-163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  55.74 
 
 		 426 aa  517  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  52.09 
 
 		 621 aa  506  9.999999999999999e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  56.73 
 
 		 487 aa  499  1e-140  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  52.07 
 
 		 659 aa  490  1e-137  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  51.17 
 
 		 426 aa  464  1e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  52.75 
 
 		 424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  49.27 
 
 		 453 aa  432  1e-120  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  52.48 
 
 		 475 aa  426  1e-118  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  48.63 
 
 		 482 aa  397  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  33.44 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  36.81 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  33.23 
 
 		 385 aa  213  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  33.23 
 
 		 385 aa  212  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  35.65 
 
 		 370 aa  209  6e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  34.26 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  35.49 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  34.47 
 
 		 381 aa  202  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  37.24 
 
 		 404 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  34.46 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  33.52 
 
 		 393 aa  186  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  33.64 
 
 		 378 aa  186  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53146  predicted protein  31.45 
 
 		 398 aa  186  9e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.217415 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  33.23 
 
 		 406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  31.67 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  34.67 
 
 		 407 aa  184  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  35.63 
 
 		 406 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  33.33 
 
 		 393 aa  183  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  33.82 
 
 		 404 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  33.82 
 
 		 388 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  33.24 
 
 		 403 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  32.02 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  35.6 
 
 		 393 aa  179  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  31.77 
 
 		 393 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  31.94 
 
 		 378 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  32.5 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  30.18 
 
 		 397 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  31.12 
 
 		 410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  32.2 
 
 		 394 aa  173  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  34.08 
 
 		 417 aa  172  9e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  30.84 
 
 		 351 aa  172  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  34.22 
 
 		 426 aa  171  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  30.75 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  33.23 
 
 		 435 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  35.61 
 
 		 348 aa  168  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  32.93 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  31.45 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  31.96 
 
 		 378 aa  167  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  31.09 
 
 		 411 aa  167  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  31.22 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  30.26 
 
 		 392 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  33 
 
 		 379 aa  164  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05260  histone deacetylase 3, putative  33.13 
 
 		 555 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  31.13 
 
 		 406 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  30.35 
 
 		 388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  30.55 
 
 		 388 aa  163  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  30.55 
 
 		 388 aa  163  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  30.55 
 
 		 388 aa  163  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  30.55 
 
 		 388 aa  163  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  30.55 
 
 		 388 aa  163  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  30.55 
 
 		 388 aa  163  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  30.23 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  29.21 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  30.23 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  30.5 
 
 		 388 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  30.23 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  29.34 
 
 		 396 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  31.52 
 
 		 414 aa  154  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  31.48 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  29.37 
 
 		 374 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  29.73 
 
 		 395 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  38.43 
 
 		 369 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  31.94 
 
 		 360 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  28.75 
 
 		 389 aa  146  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  28.75 
 
 		 389 aa  146  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0697  histone deacetylase superfamily protein  31.7 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.22424  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  31.28 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  32.26 
 
 		 390 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  37.6 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  33.44 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  28.62 
 
 		 327 aa  139  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  29.18 
 
 		 390 aa  137  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  31.09 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0594  histone deacetylase superfamily protein  30.93 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87707  predicted protein  32.99 
 
 		 480 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  30.22 
 
 		 398 aa  130  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  29.24 
 
 		 321 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  28.21 
 
 		 306 aa  125  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  26.69 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  27.16 
 
 		 331 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1556  histone deacetylase superfamily protein  31.1 
 
 		 341 aa  117  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2236  histone deacetylase superfamily protein  28.57 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2090  Histone deacetylase  31.88 
 
 		 345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  26.73 
 
 		 380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  30.66 
 
 		 315 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  38.26 
 
 		 345 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  26.58 
 
 		 380 aa  114  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>