213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1743 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1743  translocation protein TolB  100 
 
 		 421 aa  861    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00450172  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0922  translocation protein TolB  90.74 
 
 		 418 aa  790    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.484523  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1520  translocation protein TolB  63.12 
 
 		 421 aa  562  1.0000000000000001e-159  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368707  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0692  translocation protein TolB  57.55 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00862547  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0520  TolB domain protein  51.77 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0119  translocation protein TolB  52.96 
 
 		 402 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.000000000125322  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0107  translocation protein TolB  52.96 
 
 		 402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.133002  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0200  translocation protein TolB  51.9 
 
 		 399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000701864  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0147  translocation protein TolB  52.96 
 
 		 402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000145725  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1398  translocation protein TolB  44.68 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.468764  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.05 
 
 		 407 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  32.91 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  27.09 
 
 		 441 aa  106  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.9 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  28.62 
 
 		 424 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  28.17 
 
 		 442 aa  103  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  32.49 
 
 		 445 aa  103  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  28.82 
 
 		 442 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  25.42 
 
 		 428 aa  98.2  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  25.87 
 
 		 442 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  25.87 
 
 		 442 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  25.87 
 
 		 442 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  26.29 
 
 		 442 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  26.19 
 
 		 442 aa  96.7  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  25.66 
 
 		 435 aa  96.7  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  26.19 
 
 		 442 aa  96.7  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  26.19 
 
 		 442 aa  96.7  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  25.87 
 
 		 442 aa  96.7  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.11 
 
 		 429 aa  96.7  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 434 aa  95.5  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  26.25 
 
 		 442 aa  95.1  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  27.39 
 
 		 445 aa  94.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  31.82 
 
 		 432 aa  94  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  27.38 
 
 		 442 aa  93.2  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  23.7 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  25.79 
 
 		 428 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  26.19 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  23.61 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  25.86 
 
 		 422 aa  90.5  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.86 
 
 		 422 aa  90.5  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  25 
 
 		 442 aa  90.5  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  26.75 
 
 		 432 aa  90.5  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  26.91 
 
 		 414 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  26.29 
 
 		 434 aa  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  26.29 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  27.16 
 
 		 432 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  25.29 
 
 		 440 aa  87  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  25.29 
 
 		 437 aa  87  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.61 
 
 		 430 aa  87  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  25.67 
 
 		 433 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  25.67 
 
 		 433 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  27.52 
 
 		 451 aa  86.7  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  29.59 
 
 		 435 aa  86.7  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  26.27 
 
 		 443 aa  86.3  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  20.3 
 
 		 451 aa  85.5  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  24.06 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  22.95 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  25.86 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  26.29 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  26.64 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  26.32 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  26.29 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  23.88 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  25.43 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  23.42 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  23.42 
 
 		 423 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  23.42 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  24.36 
 
 		 454 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  23.42 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  24.57 
 
 		 450 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  25.42 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  27.83 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  25.65 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  27.35 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  25.1 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  21.15 
 
 		 428 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  27.35 
 
 		 431 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  27.35 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  25.1 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  23.42 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  22.67 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  26.92 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  25.11 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  23.53 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  22.87 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  22.67 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  25.32 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  24.39 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  22 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  24.02 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  25.32 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  21.97 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  23.91 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  25.22 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0536  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.64 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  24.71 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  26.18 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  26.18 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  26.18 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  22.22 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>