201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1152 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1152  integrase family protein  100 
 
 		 365 aa  753    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.379304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1049  integrase family protein  36.54 
 
 		 380 aa  227  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1421  phage integrase family protein  36.31 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  34.73 
 
 		 405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2042  integrase family protein  33.52 
 
 		 350 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0960893  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2363  phage integrase family site specific recombinase  32.67 
 
 		 368 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03598  site-specific recombinase, phage integrase family protein  32.31 
 
 		 380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.951563  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1622  phage integrase family protein  30.73 
 
 		 361 aa  159  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0745  phage integrase family protein  31.77 
 
 		 357 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107824 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4490  phage integrase family protein  32.46 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6537  normal  0.0343494 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5550  phage integrase family protein  32.46 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3233  phage integrase  33.05 
 
 		 356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1711  integrase family protein  32.69 
 
 		 380 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213299  hitchhiker  0.00000987295 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0354  phage integrase family site specific recombinase  29.44 
 
 		 355 aa  152  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0805  phage integrase family protein  30.58 
 
 		 354 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0773  phage integrase family protein  30.3 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0798  integrase family protein  30.3 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000196141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3586  phage integrase family protein  30.03 
 
 		 355 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  32.22 
 
 		 347 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2030  phage integrase family protein  30.26 
 
 		 365 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0398  shufflon-specific DNA recombinase  30.51 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  30.85 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3455  putative integrase/recombinase  30.17 
 
 		 362 aa  123  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375642  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  28.18 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  28.09 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  28.18 
 
 		 330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  28.37 
 
 		 351 aa  119  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  27.55 
 
 		 347 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  28.73 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  27.55 
 
 		 347 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  29.38 
 
 		 334 aa  116  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  29.84 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  27.25 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  28.42 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  28.3 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  29.67 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  28.11 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  28.21 
 
 		 356 aa  100  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  23.76 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0397  shufflon-specific DNA recombinase  26.48 
 
 		 353 aa  90.1  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  25.41 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  32.29 
 
 		 374 aa  87  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  25.2 
 
 		 354 aa  86.3  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  31.38 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  30.21 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  28.94 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  27.58 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  31.34 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  24.29 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0242  integrase family protein  25.71 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1571  site-specific integrase/recombinase  27.5 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  24.11 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  30.37 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  24.73 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  27.64 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  29.84 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  25 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1794  integrase family protein  28.53 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0543031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0471  integrase family protein  24.8 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116709  hitchhiker  0.000616461 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  28.03 
 
 		 222 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2234  integrase family protein  25.27 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  23.23 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03811  site-specific recombinase XerD  25.92 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2435  integrase family protein  25.13 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.061585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  28.57 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0382  putative site-specific integrase/recombinase  29.03 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7113  integrase family protein  23.36 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596865 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  25.14 
 
 		 321 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  23.72 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3178  phage integrase family protein  22.19 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0368902  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01212  site-specific recombinase, resolvase family protein  24 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2659  integrase family protein  27.16 
 
 		 531 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.91 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3125  Phage integrase  24.61 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  26.2 
 
 		 571 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  24.38 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  23.95 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  24.87 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  27.91 
 
 		 412 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.94 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  26.05 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  23.35 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  23.35 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  26.75 
 
 		 251 aa  54.7  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  21.38 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  28.57 
 
 		 429 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  28.21 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  25.13 
 
 		 400 aa  53.5  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2582  integrase  21.39 
 
 		 349 aa  53.1  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000812443  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1667  phage integrase family protein  28.16 
 
 		 372 aa  53.1  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  24.93 
 
 		 378 aa  52.8  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  28.25 
 
 		 384 aa  52.8  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  24.28 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1909  integrase family protein  44.26 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.838759  hitchhiker  0.00000212902 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  25.16 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  24.28 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  28.66 
 
 		 159 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3278  phage integrase family site specific recombinase  30.34 
 
 		 146 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  25.26 
 
 		 300 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  25.41 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>