More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6912 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5582  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0532  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  30.32 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 202 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  28.22 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  32.67 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  34.53 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  28.5 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  30.64 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  31.41 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2606  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193859  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 540 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  36.44 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  28.81 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  28.43 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
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NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  31.3 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
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NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
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NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  32.82 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
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NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
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NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
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NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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