102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2833 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  100 
 
 		 202 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1667  fimbrial protein  67.98 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.384622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2163  fimbrial protein  55.31 
 
 		 176 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2110  fimbrial protein  55.31 
 
 		 176 aa  180  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2272  fimbrial protein  55.31 
 
 		 176 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  54.19 
 
 		 176 aa  165  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  54.19 
 
 		 176 aa  165  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  54.19 
 
 		 176 aa  165  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  49.73 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  49.73 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  49.73 
 
 		 178 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  49.18 
 
 		 178 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  49.18 
 
 		 178 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0298  fimbrial protein  54.55 
 
 		 180 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1277  fimbrial protein  44.51 
 
 		 186 aa  124  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.244383 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59710  putative fimbrial protein precursor  47.28 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.45565e-17  hitchhiker  1.06825e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3023  fimbrial subunit CupA1  47.83 
 
 		 182 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  45.76 
 
 		 183 aa  117  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0293  fimbrial protein  40.32 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  41.85 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  37.95 
 
 		 186 aa  72  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  38.92 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  35.23 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  34.2 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  36.02 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  36.92 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  34.94 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  45.24 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  34.57 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  38.58 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  28.81 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  28.81 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  28.81 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  33.68 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  45.45 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  30.22 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  34.25 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  34.25 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  34.25 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  30.88 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  30.88 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  30.88 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  30.88 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1694  fimbrial protein  36.45 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857438  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  28.27 
 
 		 181 aa  52.4  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  32.32 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  30.99 
 
 		 181 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  33.33 
 
 		 175 aa  51.6  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  36.19 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  32.82 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  30.28 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  31.5 
 
 		 169 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2870  fimbrial protein  31.58 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  37.25 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  41.11 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  29.07 
 
 		 336 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  28.34 
 
 		 180 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1366  fimbrial protein  34.88 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326274  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1478  fimbrial protein  34.88 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  31.33 
 
 		 172 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  27.42 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  29.19 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  36.27 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  38.75 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  38.75 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  38.75 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  38.75 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  29.68 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  30.05 
 
 		 170 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  30.05 
 
 		 170 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  30.05 
 
 		 170 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1269  S-fimbrial adhesin protein SfaS  28.89 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.207899  normal  0.111309 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  30.43 
 
 		 177 aa  46.2  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  27.27 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  26.18 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  37.5 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  37.36 
 
 		 182 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  27.42 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  26.96 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  30.12 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  28.3 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  26.7 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  26.7 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  25.95 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  26.67 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  28.3 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4724  fimbrial protein  24.86 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0545532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  28.22 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  29.52 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  32.77 
 
 		 182 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  32.77 
 
 		 182 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  32.77 
 
 		 182 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  26.34 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  25.65 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  50 
 
 		 187 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  50 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  50 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  27.72 
 
 		 190 aa  42  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  27.72 
 
 		 190 aa  42  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  25 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>