More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1633 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 331 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  82.75 
 
 		 316 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  82.11 
 
 		 316 aa  524  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  82.75 
 
 		 316 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  81.47 
 
 		 316 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  81.47 
 
 		 316 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  81.35 
 
 		 316 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3201  LysR family transcriptional regulator  80.83 
 
 		 316 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0942378 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  70.97 
 
 		 314 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  66.56 
 
 		 316 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  69.71 
 
 		 314 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  66.89 
 
 		 319 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1141  transcriptional regulator  91.04 
 
 		 319 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  62.62 
 
 		 320 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  50.32 
 
 		 320 aa  315  5e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  48.9 
 
 		 325 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  43.96 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 321 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2353  galactose-binding protein regulator  88.32 
 
 		 138 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  42.21 
 
 		 302 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2950  LysR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 315 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 315 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 317 aa  205  7e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 312 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0289  LysR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 339 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09120  Transcriptional regulator, LysR family  35.43 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1954  transcriptional regulator, LysR family  37.95 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176573  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  36.24 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  34.3 
 
 		 334 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  32.58 
 
 		 335 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 		 335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 333 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2833  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2856  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 323 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.996776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2949  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.440503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0494  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.574474 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2459  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4576  transcriptional regulator, LysR family  35.15 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1209  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0756  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  0.852403 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1489  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 332 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 302 aa  159  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2349  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 323 aa  159  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3113  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 318 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2394  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 351 aa  153  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4472  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 307 aa  149  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 315 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2686  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 314 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 369 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 415 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 417 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 419 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4372  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7076  transcriptional regulator, LysR family  31.68 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5053  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173473  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5938  transcriptional regulator, LysR family  31.35 
 
 		 305 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.254792 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3213  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 316 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5073  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 316 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4205  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 316 aa  142  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0642  transcriptional regulator PcaQ  31 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3054  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0604  pca operon transcription factor PcaQ  31 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6124  pca operon transcription factor PcaQ  34.4 
 
 		 284 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0261121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>