97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1041 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1041  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1043  LmbE family protein  56.93 
 
 		 208 aa  218  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3392  LmbE family protein  50.7 
 
 		 218 aa  208  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0383  hypothetical protein  52.5 
 
 		 218 aa  204  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0440  hypothetical protein  52 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.584207  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0783  LmbE family protein  47.5 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3950  LmbE-like protein  45 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.591961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0637  putative deacetylase  38.18 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0368  LmbE family protein  40.49 
 
 		 235 aa  151  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.758546  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0069  LmbE family protein  36.32 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  30.54 
 
 		 207 aa  91.3  9e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  29.47 
 
 		 209 aa  88.2  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  31.5 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  25.94 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  30.24 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  31.13 
 
 		 257 aa  78.2  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  27.36 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  29.25 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  29.25 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  29.25 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  29.25 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  28.77 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  29.15 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  28.07 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  31.67 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  27.56 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  27.56 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  27.56 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  27.56 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  27.56 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  28.19 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  26.75 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  27.11 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  27.11 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  27.11 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  26.64 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  26.64 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  28.77 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  26.46 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  28.12 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0338  response regulator receiver protein  28.72 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  26.75 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  27.42 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  25.54 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  24.89 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1457  LmbE family protein  25.34 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  24.46 
 
 		 249 aa  51.6  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  25.69 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  26.64 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  23.21 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  27.01 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  25.81 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  36.67 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02910  putative LmbE-like protein  24.54 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00798316  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  27.01 
 
 		 245 aa  49.3  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  31.45 
 
 		 247 aa  49.3  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  27.56 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  25.21 
 
 		 239 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  23.89 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  31.45 
 
 		 221 aa  48.1  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  27.43 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  24.89 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  22.17 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  24.65 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  30.65 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  26.99 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  25.81 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2964  LmbE family protein  26.83 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  26.48 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  30.09 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  26.61 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  24.26 
 
 		 300 aa  45.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  28.23 
 
 		 264 aa  45.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  25 
 
 		 243 aa  45.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  30.83 
 
 		 248 aa  45.4  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  24.89 
 
 		 239 aa  45.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5396  LmbE family protein  22.97 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.910627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  27.89 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5673  LmbE family protein  25.91 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  normal  0.0103265 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  26.92 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1232  LmbE-like protein  22.22 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000113124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  24.66 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  26.71 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  25.23 
 
 		 471 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  23.95 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  24.79 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  24.34 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  21.65 
 
 		 286 aa  42.4  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  27.75 
 
 		 277 aa  42.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  27.18 
 
 		 276 aa  42.4  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  23.56 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  24.06 
 
 		 257 aa  42  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  27.56 
 
 		 270 aa  42  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  25.96 
 
 		 258 aa  42  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  27.61 
 
 		 210 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  25.11 
 
 		 248 aa  41.6  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>